Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rab28Q99KL7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rab28Q99KL7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rab28Q99KL7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rab28Q99KL7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rab28Q99KL7 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rab28Q99KL7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rab28Q99KL7 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rab28Q99KL7 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rab28Q99KL7 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rab28Q99KL7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rab28Q99KL7 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rab28Q99KL7 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rab28Q99KL7 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rab28Q99KL7 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rab28Q99KL7 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rab28Q99KL7 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rab28Q99KL7 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rab28Q99KL7 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rab28Q99KL7 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rab28Q99KL7 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rab28Q99KL7 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rab28Q99KL7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rab28Q99KL7 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rab28Q99KL7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rab28Q99KL7 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rab28Q99KL7 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Rab28Q99KL7 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rab28Q99KL7 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rab28Q99KL7 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rab28Q99KL7 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Rab28Q99KL7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rab28Q99KL7 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rab28Q99KL7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rab28Q99KL7 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Rab28Q99KL7 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rab28Q99KL7 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rab28Q99KL7 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rab28Q99KL7 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rab28Q99KL7 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rab28Q99KL7 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rab28Q99KL7 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rab28Q99KL7 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rab28Q99KL7 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rab28Q99KL7 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rab28Q99KL7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rab28Q99KL7 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rab28Q99KL7 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rab28Q99KL7 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rab28Q99KL7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rab28Q99KL7 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rab28Q99KL7 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rab28Q99KL7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rab28Q99KL7 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rab28Q99KL7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Rab28Q99KL7 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rab28Q99KL7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rab28Q99KL7 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rab28Q99KL7 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rab28Q99KL7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rab28Q99KL7 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rab28Q99KL7 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Rab28Q99KL7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rab28Q99KL7 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rab28Q99KL7 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rab28Q99KL7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rab28Q99KL7 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rab28Q99KL7 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rab28Q99KL7 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rab28Q99KL7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rab28Q99KL7 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rab28Q99KL7 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rab28Q99KL7 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Rab28Q99KL7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rab28Q99KL7 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rab28Q99KL7 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rab28Q99KL7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rab28Q99KL7 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rab28Q99KL7 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rab28Q99KL7 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Rab28Q99KL7 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Rab28Q99KL7 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Rab28Q99KL7 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rab28Q99KL7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rab28Q99KL7 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rab28Q99KL7 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rab28Q99KL7 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rab28Q99KL7 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rab28Q99KL7 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rab28Q99KL7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rab28Q99KL7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rab28Q99KL7 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rab28Q99KL7 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rab28Q99KL7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rab28Q99KL7 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rab28Q99KL7 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Rab28Q99KL7 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rab28Q99KL7 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Rab28Q99KL7 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rab28Q99KL7 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms