Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TrabdQ99JY4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TrabdQ99JY4 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TrabdQ99JY4 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TrabdQ99JY4 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TrabdQ99JY4 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TrabdQ99JY4 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TrabdQ99JY4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TrabdQ99JY4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TrabdQ99JY4 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TrabdQ99JY4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TrabdQ99JY4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TrabdQ99JY4 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TrabdQ99JY4 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TrabdQ99JY4 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TrabdQ99JY4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TrabdQ99JY4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TrabdQ99JY4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TrabdQ99JY4 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TrabdQ99JY4 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TrabdQ99JY4 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TrabdQ99JY4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TrabdQ99JY4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TrabdQ99JY4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TrabdQ99JY4 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TrabdQ99JY4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TrabdQ99JY4 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TrabdQ99JY4 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TrabdQ99JY4 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TrabdQ99JY4 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TrabdQ99JY4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TrabdQ99JY4 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TrabdQ99JY4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TrabdQ99JY4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TrabdQ99JY4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TrabdQ99JY4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TrabdQ99JY4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TrabdQ99JY4 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TrabdQ99JY4 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TrabdQ99JY4 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TrabdQ99JY4 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TrabdQ99JY4 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TrabdQ99JY4 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TrabdQ99JY4 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TrabdQ99JY4 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TrabdQ99JY4 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TrabdQ99JY4 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TrabdQ99JY4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TrabdQ99JY4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TrabdQ99JY4 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TrabdQ99JY4 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TrabdQ99JY4 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TrabdQ99JY4 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TrabdQ99JY4 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TrabdQ99JY4 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TrabdQ99JY4 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TrabdQ99JY4 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TrabdQ99JY4 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TrabdQ99JY4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TrabdQ99JY4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TrabdQ99JY4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TrabdQ99JY4 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TrabdQ99JY4 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TrabdQ99JY4 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TrabdQ99JY4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TrabdQ99JY4 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TrabdQ99JY4 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TrabdQ99JY4 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TrabdQ99JY4 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TrabdQ99JY4 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TrabdQ99JY4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TrabdQ99JY4 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TrabdQ99JY4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TrabdQ99JY4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TrabdQ99JY4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TrabdQ99JY4 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TrabdQ99JY4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TrabdQ99JY4 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TrabdQ99JY4 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TrabdQ99JY4 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TrabdQ99JY4 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TrabdQ99JY4 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TrabdQ99JY4 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TrabdQ99JY4 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TrabdQ99JY4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TrabdQ99JY4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TrabdQ99JY4 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TrabdQ99JY4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TrabdQ99JY4 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TrabdQ99JY4 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TrabdQ99JY4 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TrabdQ99JY4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TrabdQ99JY4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TrabdQ99JY4 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TrabdQ99JY4 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TrabdQ99JY4 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TrabdQ99JY4 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TrabdQ99JY4 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TrabdQ99JY4 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TrabdQ99JY4 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms