Protein–RNA interactions for Protein: Q925E0

Sntg2, Gamma-2-syntrophin, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sntg2Q925E0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sntg2Q925E0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sntg2Q925E0 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Sntg2Q925E0 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sntg2Q925E0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sntg2Q925E0 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sntg2Q925E0 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sntg2Q925E0 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sntg2Q925E0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sntg2Q925E0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sntg2Q925E0 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sntg2Q925E0 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sntg2Q925E0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sntg2Q925E0 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sntg2Q925E0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sntg2Q925E0 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sntg2Q925E0 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sntg2Q925E0 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sntg2Q925E0 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sntg2Q925E0 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sntg2Q925E0 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sntg2Q925E0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sntg2Q925E0 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sntg2Q925E0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sntg2Q925E0 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sntg2Q925E0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sntg2Q925E0 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sntg2Q925E0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sntg2Q925E0 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sntg2Q925E0 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sntg2Q925E0 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sntg2Q925E0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sntg2Q925E0 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sntg2Q925E0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sntg2Q925E0 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sntg2Q925E0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sntg2Q925E0 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sntg2Q925E0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sntg2Q925E0 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sntg2Q925E0 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Sntg2Q925E0 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sntg2Q925E0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Sntg2Q925E0 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sntg2Q925E0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sntg2Q925E0 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sntg2Q925E0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sntg2Q925E0 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sntg2Q925E0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sntg2Q925E0 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sntg2Q925E0 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sntg2Q925E0 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sntg2Q925E0 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sntg2Q925E0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sntg2Q925E0 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sntg2Q925E0 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sntg2Q925E0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sntg2Q925E0 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sntg2Q925E0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sntg2Q925E0 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sntg2Q925E0 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Sntg2Q925E0 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sntg2Q925E0 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sntg2Q925E0 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sntg2Q925E0 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sntg2Q925E0 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Sntg2Q925E0 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sntg2Q925E0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sntg2Q925E0 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sntg2Q925E0 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sntg2Q925E0 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sntg2Q925E0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sntg2Q925E0 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sntg2Q925E0 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Sntg2Q925E0 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sntg2Q925E0 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sntg2Q925E0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sntg2Q925E0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sntg2Q925E0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sntg2Q925E0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sntg2Q925E0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sntg2Q925E0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sntg2Q925E0 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Sntg2Q925E0 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sntg2Q925E0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Sntg2Q925E0 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sntg2Q925E0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sntg2Q925E0 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sntg2Q925E0 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sntg2Q925E0 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sntg2Q925E0 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sntg2Q925E0 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sntg2Q925E0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sntg2Q925E0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sntg2Q925E0 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sntg2Q925E0 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sntg2Q925E0 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sntg2Q925E0 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sntg2Q925E0 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sntg2Q925E0 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sntg2Q925E0 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms