Protein–RNA interactions for Protein: Q924T3

Xrcc4, DNA repair protein XRCC4, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc4Q924T3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Xrcc4Q924T3 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Xrcc4Q924T3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Xrcc4Q924T3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Xrcc4Q924T3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Xrcc4Q924T3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Xrcc4Q924T3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Xrcc4Q924T3 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Xrcc4Q924T3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Xrcc4Q924T3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Xrcc4Q924T3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Xrcc4Q924T3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Xrcc4Q924T3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Xrcc4Q924T3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Xrcc4Q924T3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Xrcc4Q924T3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Xrcc4Q924T3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Xrcc4Q924T3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Xrcc4Q924T3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Xrcc4Q924T3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Xrcc4Q924T3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Xrcc4Q924T3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Xrcc4Q924T3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Xrcc4Q924T3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Xrcc4Q924T3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Xrcc4Q924T3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Xrcc4Q924T3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Xrcc4Q924T3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Xrcc4Q924T3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Xrcc4Q924T3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Xrcc4Q924T3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Xrcc4Q924T3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Xrcc4Q924T3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Xrcc4Q924T3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Xrcc4Q924T3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Xrcc4Q924T3 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Xrcc4Q924T3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Xrcc4Q924T3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Xrcc4Q924T3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Xrcc4Q924T3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Xrcc4Q924T3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Xrcc4Q924T3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Xrcc4Q924T3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Xrcc4Q924T3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Xrcc4Q924T3 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Xrcc4Q924T3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Xrcc4Q924T3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Xrcc4Q924T3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Xrcc4Q924T3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Xrcc4Q924T3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Xrcc4Q924T3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Xrcc4Q924T3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Xrcc4Q924T3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Xrcc4Q924T3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Xrcc4Q924T3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Xrcc4Q924T3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Xrcc4Q924T3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Xrcc4Q924T3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Xrcc4Q924T3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Xrcc4Q924T3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Xrcc4Q924T3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Xrcc4Q924T3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Xrcc4Q924T3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Xrcc4Q924T3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Xrcc4Q924T3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Xrcc4Q924T3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Xrcc4Q924T3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Xrcc4Q924T3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Xrcc4Q924T3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Xrcc4Q924T3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Xrcc4Q924T3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Xrcc4Q924T3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Xrcc4Q924T3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Xrcc4Q924T3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Xrcc4Q924T3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Xrcc4Q924T3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Xrcc4Q924T3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Xrcc4Q924T3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Xrcc4Q924T3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Xrcc4Q924T3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Xrcc4Q924T3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Xrcc4Q924T3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Xrcc4Q924T3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Xrcc4Q924T3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Xrcc4Q924T3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Xrcc4Q924T3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Xrcc4Q924T3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Xrcc4Q924T3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Xrcc4Q924T3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Xrcc4Q924T3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Xrcc4Q924T3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Xrcc4Q924T3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Xrcc4Q924T3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Xrcc4Q924T3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Xrcc4Q924T3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Xrcc4Q924T3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Xrcc4Q924T3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Xrcc4Q924T3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Xrcc4Q924T3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Xrcc4Q924T3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms