Protein–RNA interactions for Protein: Q923D4

Sf3b5, Splicing factor 3B subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b5Q923D4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sf3b5Q923D4 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sf3b5Q923D4 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sf3b5Q923D4 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Sf3b5Q923D4 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sf3b5Q923D4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sf3b5Q923D4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sf3b5Q923D4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sf3b5Q923D4 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sf3b5Q923D4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sf3b5Q923D4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sf3b5Q923D4 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sf3b5Q923D4 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sf3b5Q923D4 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sf3b5Q923D4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sf3b5Q923D4 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sf3b5Q923D4 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sf3b5Q923D4 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sf3b5Q923D4 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sf3b5Q923D4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sf3b5Q923D4 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sf3b5Q923D4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sf3b5Q923D4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sf3b5Q923D4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sf3b5Q923D4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sf3b5Q923D4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sf3b5Q923D4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sf3b5Q923D4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sf3b5Q923D4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sf3b5Q923D4 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sf3b5Q923D4 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Sf3b5Q923D4 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sf3b5Q923D4 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sf3b5Q923D4 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Sf3b5Q923D4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Sf3b5Q923D4 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sf3b5Q923D4 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sf3b5Q923D4 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sf3b5Q923D4 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sf3b5Q923D4 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Sf3b5Q923D4 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sf3b5Q923D4 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sf3b5Q923D4 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sf3b5Q923D4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sf3b5Q923D4 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sf3b5Q923D4 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sf3b5Q923D4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sf3b5Q923D4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sf3b5Q923D4 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sf3b5Q923D4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sf3b5Q923D4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sf3b5Q923D4 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sf3b5Q923D4 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sf3b5Q923D4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sf3b5Q923D4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sf3b5Q923D4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sf3b5Q923D4 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sf3b5Q923D4 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sf3b5Q923D4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sf3b5Q923D4 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sf3b5Q923D4 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sf3b5Q923D4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sf3b5Q923D4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sf3b5Q923D4 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sf3b5Q923D4 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sf3b5Q923D4 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sf3b5Q923D4 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sf3b5Q923D4 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sf3b5Q923D4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sf3b5Q923D4 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sf3b5Q923D4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sf3b5Q923D4 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sf3b5Q923D4 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sf3b5Q923D4 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sf3b5Q923D4 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sf3b5Q923D4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sf3b5Q923D4 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sf3b5Q923D4 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sf3b5Q923D4 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sf3b5Q923D4 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sf3b5Q923D4 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sf3b5Q923D4 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sf3b5Q923D4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sf3b5Q923D4 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sf3b5Q923D4 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sf3b5Q923D4 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sf3b5Q923D4 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sf3b5Q923D4 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sf3b5Q923D4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sf3b5Q923D4 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sf3b5Q923D4 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sf3b5Q923D4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sf3b5Q923D4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sf3b5Q923D4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sf3b5Q923D4 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sf3b5Q923D4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sf3b5Q923D4 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sf3b5Q923D4 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sf3b5Q923D4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sf3b5Q923D4 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms