Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Clip1Q922J3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
Clip1Q922J3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Clip1Q922J3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Clip1Q922J3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Clip1Q922J3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Clip1Q922J3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Clip1Q922J3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Clip1Q922J3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Clip1Q922J3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Clip1Q922J3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
Clip1Q922J3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Clip1Q922J3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Clip1Q922J3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
Clip1Q922J3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Clip1Q922J3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Clip1Q922J3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Clip1Q922J3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Clip1Q922J3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Clip1Q922J3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Clip1Q922J3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Clip1Q922J3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Clip1Q922J3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Clip1Q922J3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Clip1Q922J3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Clip1Q922J3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Clip1Q922J3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Clip1Q922J3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Clip1Q922J3 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Clip1Q922J3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Clip1Q922J3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Clip1Q922J3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Clip1Q922J3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Clip1Q922J3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Clip1Q922J3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Clip1Q922J3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Clip1Q922J3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Clip1Q922J3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Clip1Q922J3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Clip1Q922J3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Clip1Q922J3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
Clip1Q922J3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
Clip1Q922J3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Clip1Q922J3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Clip1Q922J3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Clip1Q922J3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Clip1Q922J3 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Clip1Q922J3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Clip1Q922J3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Clip1Q922J3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Clip1Q922J3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC30.51■■■□□ 2.48
Clip1Q922J3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Clip1Q922J3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Clip1Q922J3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Clip1Q922J3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Clip1Q922J3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Clip1Q922J3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
Clip1Q922J3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Clip1Q922J3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Clip1Q922J3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Clip1Q922J3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Clip1Q922J3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Clip1Q922J3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Clip1Q922J3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Clip1Q922J3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
Clip1Q922J3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Clip1Q922J3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Clip1Q922J3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Clip1Q922J3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Clip1Q922J3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Clip1Q922J3 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
Clip1Q922J3 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Clip1Q922J3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Clip1Q922J3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Clip1Q922J3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Clip1Q922J3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Clip1Q922J3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Clip1Q922J3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Clip1Q922J3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
Clip1Q922J3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Clip1Q922J3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Clip1Q922J3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Clip1Q922J3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Clip1Q922J3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Clip1Q922J3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Clip1Q922J3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Clip1Q922J3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Clip1Q922J3 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Clip1Q922J3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Clip1Q922J3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Clip1Q922J3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Clip1Q922J3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Clip1Q922J3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Clip1Q922J3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Clip1Q922J3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Clip1Q922J3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Clip1Q922J3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
Clip1Q922J3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Clip1Q922J3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Clip1Q922J3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms