Protein–RNA interactions for Protein: Q921M3

Sf3b3, Splicing factor 3B subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b3Q921M3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sf3b3Q921M3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sf3b3Q921M3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sf3b3Q921M3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sf3b3Q921M3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sf3b3Q921M3 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sf3b3Q921M3 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sf3b3Q921M3 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sf3b3Q921M3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sf3b3Q921M3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sf3b3Q921M3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sf3b3Q921M3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Sf3b3Q921M3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sf3b3Q921M3 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sf3b3Q921M3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Sf3b3Q921M3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sf3b3Q921M3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sf3b3Q921M3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sf3b3Q921M3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sf3b3Q921M3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sf3b3Q921M3 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sf3b3Q921M3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sf3b3Q921M3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sf3b3Q921M3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sf3b3Q921M3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sf3b3Q921M3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sf3b3Q921M3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sf3b3Q921M3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sf3b3Q921M3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sf3b3Q921M3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sf3b3Q921M3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sf3b3Q921M3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Sf3b3Q921M3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Sf3b3Q921M3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sf3b3Q921M3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sf3b3Q921M3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sf3b3Q921M3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sf3b3Q921M3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sf3b3Q921M3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sf3b3Q921M3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sf3b3Q921M3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sf3b3Q921M3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sf3b3Q921M3 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sf3b3Q921M3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sf3b3Q921M3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sf3b3Q921M3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sf3b3Q921M3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sf3b3Q921M3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sf3b3Q921M3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Sf3b3Q921M3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sf3b3Q921M3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sf3b3Q921M3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sf3b3Q921M3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sf3b3Q921M3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sf3b3Q921M3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sf3b3Q921M3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sf3b3Q921M3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sf3b3Q921M3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Sf3b3Q921M3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sf3b3Q921M3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sf3b3Q921M3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sf3b3Q921M3 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sf3b3Q921M3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sf3b3Q921M3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Sf3b3Q921M3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sf3b3Q921M3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sf3b3Q921M3 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sf3b3Q921M3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sf3b3Q921M3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sf3b3Q921M3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sf3b3Q921M3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sf3b3Q921M3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sf3b3Q921M3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sf3b3Q921M3 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Sf3b3Q921M3 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sf3b3Q921M3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sf3b3Q921M3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sf3b3Q921M3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Sf3b3Q921M3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Sf3b3Q921M3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sf3b3Q921M3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sf3b3Q921M3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sf3b3Q921M3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sf3b3Q921M3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sf3b3Q921M3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sf3b3Q921M3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sf3b3Q921M3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sf3b3Q921M3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sf3b3Q921M3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sf3b3Q921M3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sf3b3Q921M3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sf3b3Q921M3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sf3b3Q921M3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sf3b3Q921M3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sf3b3Q921M3 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Sf3b3Q921M3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Sf3b3Q921M3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sf3b3Q921M3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sf3b3Q921M3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sf3b3Q921M3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms