Protein–RNA interactions for Protein: Q921I6

Sh3bp4, SH3 domain-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp4Q921I6 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh3bp4Q921I6 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh3bp4Q921I6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh3bp4Q921I6 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh3bp4Q921I6 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh3bp4Q921I6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh3bp4Q921I6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh3bp4Q921I6 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh3bp4Q921I6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp4Q921I6 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp4Q921I6 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp4Q921I6 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp4Q921I6 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp4Q921I6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp4Q921I6 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp4Q921I6 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp4Q921I6 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp4Q921I6 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp4Q921I6 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp4Q921I6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp4Q921I6 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp4Q921I6 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh3bp4Q921I6 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3bp4Q921I6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3bp4Q921I6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3bp4Q921I6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3bp4Q921I6 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3bp4Q921I6 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3bp4Q921I6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3bp4Q921I6 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3bp4Q921I6 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3bp4Q921I6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3bp4Q921I6 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3bp4Q921I6 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh3bp4Q921I6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp4Q921I6 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp4Q921I6 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp4Q921I6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp4Q921I6 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp4Q921I6 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp4Q921I6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp4Q921I6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp4Q921I6 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp4Q921I6 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp4Q921I6 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh3bp4Q921I6 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh3bp4Q921I6 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh3bp4Q921I6 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh3bp4Q921I6 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh3bp4Q921I6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh3bp4Q921I6 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh3bp4Q921I6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh3bp4Q921I6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh3bp4Q921I6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh3bp4Q921I6 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh3bp4Q921I6 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh3bp4Q921I6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh3bp4Q921I6 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh3bp4Q921I6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh3bp4Q921I6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh3bp4Q921I6 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh3bp4Q921I6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh3bp4Q921I6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh3bp4Q921I6 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh3bp4Q921I6 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh3bp4Q921I6 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh3bp4Q921I6 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh3bp4Q921I6 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh3bp4Q921I6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh3bp4Q921I6 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh3bp4Q921I6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh3bp4Q921I6 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh3bp4Q921I6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh3bp4Q921I6 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh3bp4Q921I6 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh3bp4Q921I6 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh3bp4Q921I6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh3bp4Q921I6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh3bp4Q921I6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh3bp4Q921I6 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh3bp4Q921I6 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh3bp4Q921I6 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh3bp4Q921I6 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh3bp4Q921I6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh3bp4Q921I6 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Sh3bp4Q921I6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sh3bp4Q921I6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sh3bp4Q921I6 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sh3bp4Q921I6 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sh3bp4Q921I6 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sh3bp4Q921I6 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp4Q921I6 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp4Q921I6 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp4Q921I6 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp4Q921I6 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp4Q921I6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp4Q921I6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp4Q921I6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp4Q921I6 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh3bp4Q921I6 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms