Protein–RNA interactions for Protein: Q920N1

Odf3, Outer dense fiber protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf3Q920N1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Odf3Q920N1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Odf3Q920N1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Odf3Q920N1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Odf3Q920N1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Odf3Q920N1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Odf3Q920N1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Odf3Q920N1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Odf3Q920N1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Odf3Q920N1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Odf3Q920N1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Odf3Q920N1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Odf3Q920N1 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Odf3Q920N1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Odf3Q920N1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Odf3Q920N1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Odf3Q920N1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Odf3Q920N1 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Odf3Q920N1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Odf3Q920N1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Odf3Q920N1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Odf3Q920N1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Odf3Q920N1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Odf3Q920N1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Odf3Q920N1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Odf3Q920N1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Odf3Q920N1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Odf3Q920N1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Odf3Q920N1 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Odf3Q920N1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Odf3Q920N1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Odf3Q920N1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Odf3Q920N1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Odf3Q920N1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Odf3Q920N1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Odf3Q920N1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Odf3Q920N1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Odf3Q920N1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Odf3Q920N1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Odf3Q920N1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Odf3Q920N1 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Odf3Q920N1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Odf3Q920N1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Odf3Q920N1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Odf3Q920N1 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Odf3Q920N1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Odf3Q920N1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Odf3Q920N1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Odf3Q920N1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Odf3Q920N1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Odf3Q920N1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Odf3Q920N1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Odf3Q920N1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Odf3Q920N1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Odf3Q920N1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Odf3Q920N1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Odf3Q920N1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Odf3Q920N1 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Odf3Q920N1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Odf3Q920N1 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Odf3Q920N1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Odf3Q920N1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Odf3Q920N1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Odf3Q920N1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Odf3Q920N1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Odf3Q920N1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Odf3Q920N1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Odf3Q920N1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Odf3Q920N1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Odf3Q920N1 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Odf3Q920N1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Odf3Q920N1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Odf3Q920N1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Odf3Q920N1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Odf3Q920N1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Odf3Q920N1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Odf3Q920N1 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Odf3Q920N1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Odf3Q920N1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Odf3Q920N1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Odf3Q920N1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Odf3Q920N1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Odf3Q920N1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Odf3Q920N1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Odf3Q920N1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Odf3Q920N1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Odf3Q920N1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Odf3Q920N1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Odf3Q920N1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Odf3Q920N1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Odf3Q920N1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Odf3Q920N1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Odf3Q920N1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Odf3Q920N1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Odf3Q920N1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Odf3Q920N1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Odf3Q920N1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Odf3Q920N1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Odf3Q920N1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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