Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Med28Q920D3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Med28Q920D3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Med28Q920D3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Med28Q920D3 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Med28Q920D3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Med28Q920D3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Med28Q920D3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Med28Q920D3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Med28Q920D3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Med28Q920D3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Med28Q920D3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Med28Q920D3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Med28Q920D3 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Med28Q920D3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Med28Q920D3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Med28Q920D3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Med28Q920D3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Med28Q920D3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Med28Q920D3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Med28Q920D3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Med28Q920D3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Med28Q920D3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Med28Q920D3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Med28Q920D3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Med28Q920D3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Med28Q920D3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Med28Q920D3 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Med28Q920D3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Med28Q920D3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Med28Q920D3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Med28Q920D3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Med28Q920D3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Med28Q920D3 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Med28Q920D3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Med28Q920D3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Med28Q920D3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Med28Q920D3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Med28Q920D3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Med28Q920D3 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Med28Q920D3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Med28Q920D3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Med28Q920D3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Med28Q920D3 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Med28Q920D3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Med28Q920D3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Med28Q920D3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Med28Q920D3 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Med28Q920D3 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Med28Q920D3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Med28Q920D3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Med28Q920D3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Med28Q920D3 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Med28Q920D3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Med28Q920D3 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Med28Q920D3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Med28Q920D3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Med28Q920D3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Med28Q920D3 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Med28Q920D3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Med28Q920D3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Med28Q920D3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Med28Q920D3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Med28Q920D3 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Med28Q920D3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Med28Q920D3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Med28Q920D3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Med28Q920D3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Med28Q920D3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Med28Q920D3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Med28Q920D3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Med28Q920D3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Med28Q920D3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Med28Q920D3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Med28Q920D3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Med28Q920D3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Med28Q920D3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Med28Q920D3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Med28Q920D3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Med28Q920D3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Med28Q920D3 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Med28Q920D3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Med28Q920D3 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Med28Q920D3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med28Q920D3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med28Q920D3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med28Q920D3 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med28Q920D3 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med28Q920D3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med28Q920D3 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med28Q920D3 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med28Q920D3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med28Q920D3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med28Q920D3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med28Q920D3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Med28Q920D3 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Med28Q920D3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Med28Q920D3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Med28Q920D3 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Med28Q920D3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms