Protein–RNA interactions for Protein: Q91YK0

Lrrc49, Leucine-rich repeat-containing protein 49, mousemouse

Predictions only

Length 686 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc49Q91YK0 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lrrc49Q91YK0 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lrrc49Q91YK0 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Lrrc49Q91YK0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lrrc49Q91YK0 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lrrc49Q91YK0 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Lrrc49Q91YK0 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc49Q91YK0 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc49Q91YK0 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc49Q91YK0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc49Q91YK0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc49Q91YK0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc49Q91YK0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc49Q91YK0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc49Q91YK0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc49Q91YK0 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc49Q91YK0 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc49Q91YK0 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc49Q91YK0 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Lrrc49Q91YK0 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc49Q91YK0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc49Q91YK0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc49Q91YK0 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc49Q91YK0 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc49Q91YK0 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc49Q91YK0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc49Q91YK0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc49Q91YK0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc49Q91YK0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc49Q91YK0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc49Q91YK0 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc49Q91YK0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc49Q91YK0 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Lrrc49Q91YK0 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc49Q91YK0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc49Q91YK0 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc49Q91YK0 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc49Q91YK0 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc49Q91YK0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc49Q91YK0 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc49Q91YK0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc49Q91YK0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc49Q91YK0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc49Q91YK0 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc49Q91YK0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc49Q91YK0 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Lrrc49Q91YK0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc49Q91YK0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc49Q91YK0 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc49Q91YK0 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc49Q91YK0 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc49Q91YK0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc49Q91YK0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc49Q91YK0 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc49Q91YK0 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc49Q91YK0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc49Q91YK0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc49Q91YK0 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc49Q91YK0 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Lrrc49Q91YK0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc49Q91YK0 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc49Q91YK0 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc49Q91YK0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc49Q91YK0 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc49Q91YK0 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc49Q91YK0 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc49Q91YK0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc49Q91YK0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc49Q91YK0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc49Q91YK0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc49Q91YK0 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lrrc49Q91YK0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrc49Q91YK0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrc49Q91YK0 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrc49Q91YK0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrc49Q91YK0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrc49Q91YK0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrc49Q91YK0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrc49Q91YK0 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrc49Q91YK0 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrc49Q91YK0 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrc49Q91YK0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrc49Q91YK0 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Lrrc49Q91YK0 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrc49Q91YK0 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrc49Q91YK0 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrc49Q91YK0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrc49Q91YK0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrc49Q91YK0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrc49Q91YK0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrc49Q91YK0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrc49Q91YK0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrc49Q91YK0 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrc49Q91YK0 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrc49Q91YK0 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrc49Q91YK0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrc49Q91YK0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrc49Q91YK0 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrc49Q91YK0 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrc49Q91YK0 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms