Protein–RNA interactions for Protein: Q91WD4

UPF0415 protein C7orf25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q91WD4 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q91WD4 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q91WD4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q91WD4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q91WD4 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Q91WD4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q91WD4 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q91WD4 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q91WD4 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q91WD4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q91WD4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q91WD4 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q91WD4 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q91WD4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q91WD4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Q91WD4 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q91WD4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q91WD4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q91WD4 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Q91WD4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q91WD4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q91WD4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q91WD4 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q91WD4 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q91WD4 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Q91WD4 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Q91WD4 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Q91WD4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q91WD4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q91WD4 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q91WD4 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q91WD4 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q91WD4 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Q91WD4 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Q91WD4 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q91WD4 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q91WD4 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q91WD4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q91WD4 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q91WD4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q91WD4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Q91WD4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q91WD4 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q91WD4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q91WD4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q91WD4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q91WD4 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q91WD4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q91WD4 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q91WD4 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q91WD4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q91WD4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q91WD4 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q91WD4 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q91WD4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q91WD4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q91WD4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q91WD4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q91WD4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q91WD4 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q91WD4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q91WD4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q91WD4 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q91WD4 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q91WD4 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q91WD4 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q91WD4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q91WD4 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q91WD4 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q91WD4 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q91WD4 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q91WD4 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q91WD4 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q91WD4 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q91WD4 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q91WD4 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q91WD4 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q91WD4 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q91WD4 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q91WD4 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q91WD4 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q91WD4 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Q91WD4 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q91WD4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q91WD4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q91WD4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q91WD4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q91WD4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Q91WD4 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q91WD4 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q91WD4 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q91WD4 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q91WD4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q91WD4 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q91WD4 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q91WD4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q91WD4 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q91WD4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q91WD4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q91WD4 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms