Protein–RNA interactions for Protein: Q91W78

Usb1, U6 snRNA phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usb1Q91W78 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Usb1Q91W78 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Usb1Q91W78 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usb1Q91W78 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usb1Q91W78 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usb1Q91W78 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usb1Q91W78 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usb1Q91W78 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usb1Q91W78 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usb1Q91W78 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usb1Q91W78 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usb1Q91W78 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usb1Q91W78 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usb1Q91W78 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usb1Q91W78 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usb1Q91W78 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usb1Q91W78 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usb1Q91W78 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usb1Q91W78 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usb1Q91W78 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usb1Q91W78 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usb1Q91W78 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usb1Q91W78 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usb1Q91W78 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usb1Q91W78 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usb1Q91W78 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usb1Q91W78 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usb1Q91W78 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usb1Q91W78 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usb1Q91W78 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usb1Q91W78 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Usb1Q91W78 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usb1Q91W78 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usb1Q91W78 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usb1Q91W78 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usb1Q91W78 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usb1Q91W78 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usb1Q91W78 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usb1Q91W78 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usb1Q91W78 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usb1Q91W78 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usb1Q91W78 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usb1Q91W78 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usb1Q91W78 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Usb1Q91W78 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usb1Q91W78 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usb1Q91W78 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usb1Q91W78 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usb1Q91W78 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usb1Q91W78 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usb1Q91W78 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usb1Q91W78 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usb1Q91W78 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usb1Q91W78 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usb1Q91W78 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usb1Q91W78 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usb1Q91W78 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usb1Q91W78 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usb1Q91W78 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usb1Q91W78 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usb1Q91W78 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usb1Q91W78 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usb1Q91W78 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usb1Q91W78 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usb1Q91W78 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usb1Q91W78 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usb1Q91W78 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usb1Q91W78 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usb1Q91W78 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usb1Q91W78 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Usb1Q91W78 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usb1Q91W78 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usb1Q91W78 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usb1Q91W78 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usb1Q91W78 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usb1Q91W78 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usb1Q91W78 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usb1Q91W78 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usb1Q91W78 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usb1Q91W78 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Usb1Q91W78 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usb1Q91W78 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usb1Q91W78 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usb1Q91W78 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usb1Q91W78 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Usb1Q91W78 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Usb1Q91W78 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usb1Q91W78 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usb1Q91W78 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Usb1Q91W78 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usb1Q91W78 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usb1Q91W78 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usb1Q91W78 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usb1Q91W78 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usb1Q91W78 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usb1Q91W78 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usb1Q91W78 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usb1Q91W78 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usb1Q91W78 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Usb1Q91W78 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms