Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG0

Ccdc71, Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71Q8VEG0 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc71Q8VEG0 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc71Q8VEG0 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc71Q8VEG0 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc71Q8VEG0 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc71Q8VEG0 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc71Q8VEG0 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc71Q8VEG0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc71Q8VEG0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc71Q8VEG0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc71Q8VEG0 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc71Q8VEG0 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc71Q8VEG0 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc71Q8VEG0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc71Q8VEG0 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc71Q8VEG0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc71Q8VEG0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc71Q8VEG0 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc71Q8VEG0 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc71Q8VEG0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc71Q8VEG0 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc71Q8VEG0 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc71Q8VEG0 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc71Q8VEG0 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc71Q8VEG0 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc71Q8VEG0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc71Q8VEG0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc71Q8VEG0 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc71Q8VEG0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc71Q8VEG0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc71Q8VEG0 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc71Q8VEG0 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc71Q8VEG0 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc71Q8VEG0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc71Q8VEG0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc71Q8VEG0 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc71Q8VEG0 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc71Q8VEG0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc71Q8VEG0 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc71Q8VEG0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc71Q8VEG0 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc71Q8VEG0 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc71Q8VEG0 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc71Q8VEG0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc71Q8VEG0 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc71Q8VEG0 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc71Q8VEG0 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc71Q8VEG0 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc71Q8VEG0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc71Q8VEG0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc71Q8VEG0 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc71Q8VEG0 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc71Q8VEG0 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc71Q8VEG0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc71Q8VEG0 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc71Q8VEG0 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc71Q8VEG0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc71Q8VEG0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc71Q8VEG0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc71Q8VEG0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc71Q8VEG0 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc71Q8VEG0 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc71Q8VEG0 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc71Q8VEG0 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc71Q8VEG0 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc71Q8VEG0 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc71Q8VEG0 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc71Q8VEG0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc71Q8VEG0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc71Q8VEG0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc71Q8VEG0 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc71Q8VEG0 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc71Q8VEG0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc71Q8VEG0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc71Q8VEG0 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc71Q8VEG0 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc71Q8VEG0 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc71Q8VEG0 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc71Q8VEG0 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc71Q8VEG0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc71Q8VEG0 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc71Q8VEG0 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc71Q8VEG0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc71Q8VEG0 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc71Q8VEG0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc71Q8VEG0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc71Q8VEG0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc71Q8VEG0 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc71Q8VEG0 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc71Q8VEG0 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc71Q8VEG0 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc71Q8VEG0 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc71Q8VEG0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc71Q8VEG0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc71Q8VEG0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc71Q8VEG0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc71Q8VEG0 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc71Q8VEG0 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc71Q8VEG0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc71Q8VEG0 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 322 ms