Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDU5

Snrk, SNF-related serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrkQ8VDU5 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SnrkQ8VDU5 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SnrkQ8VDU5 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SnrkQ8VDU5 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SnrkQ8VDU5 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SnrkQ8VDU5 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SnrkQ8VDU5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SnrkQ8VDU5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SnrkQ8VDU5 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SnrkQ8VDU5 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SnrkQ8VDU5 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SnrkQ8VDU5 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SnrkQ8VDU5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SnrkQ8VDU5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SnrkQ8VDU5 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SnrkQ8VDU5 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SnrkQ8VDU5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SnrkQ8VDU5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SnrkQ8VDU5 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SnrkQ8VDU5 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SnrkQ8VDU5 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SnrkQ8VDU5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SnrkQ8VDU5 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SnrkQ8VDU5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SnrkQ8VDU5 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SnrkQ8VDU5 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SnrkQ8VDU5 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SnrkQ8VDU5 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SnrkQ8VDU5 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SnrkQ8VDU5 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SnrkQ8VDU5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SnrkQ8VDU5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SnrkQ8VDU5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SnrkQ8VDU5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SnrkQ8VDU5 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SnrkQ8VDU5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SnrkQ8VDU5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SnrkQ8VDU5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SnrkQ8VDU5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SnrkQ8VDU5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SnrkQ8VDU5 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SnrkQ8VDU5 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SnrkQ8VDU5 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SnrkQ8VDU5 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SnrkQ8VDU5 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SnrkQ8VDU5 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SnrkQ8VDU5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SnrkQ8VDU5 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SnrkQ8VDU5 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SnrkQ8VDU5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SnrkQ8VDU5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SnrkQ8VDU5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SnrkQ8VDU5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SnrkQ8VDU5 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SnrkQ8VDU5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SnrkQ8VDU5 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SnrkQ8VDU5 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SnrkQ8VDU5 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SnrkQ8VDU5 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SnrkQ8VDU5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SnrkQ8VDU5 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SnrkQ8VDU5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SnrkQ8VDU5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SnrkQ8VDU5 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SnrkQ8VDU5 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SnrkQ8VDU5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SnrkQ8VDU5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SnrkQ8VDU5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SnrkQ8VDU5 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SnrkQ8VDU5 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SnrkQ8VDU5 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SnrkQ8VDU5 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SnrkQ8VDU5 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SnrkQ8VDU5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SnrkQ8VDU5 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SnrkQ8VDU5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SnrkQ8VDU5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SnrkQ8VDU5 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SnrkQ8VDU5 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SnrkQ8VDU5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SnrkQ8VDU5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SnrkQ8VDU5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SnrkQ8VDU5 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SnrkQ8VDU5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SnrkQ8VDU5 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SnrkQ8VDU5 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SnrkQ8VDU5 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SnrkQ8VDU5 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SnrkQ8VDU5 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SnrkQ8VDU5 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SnrkQ8VDU5 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SnrkQ8VDU5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SnrkQ8VDU5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SnrkQ8VDU5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SnrkQ8VDU5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SnrkQ8VDU5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SnrkQ8VDU5 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SnrkQ8VDU5 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SnrkQ8VDU5 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SnrkQ8VDU5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms