Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD72

Ttc8, Tetratricopeptide repeat protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc8Q8VD72 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ttc8Q8VD72 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ttc8Q8VD72 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ttc8Q8VD72 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ttc8Q8VD72 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ttc8Q8VD72 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ttc8Q8VD72 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ttc8Q8VD72 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ttc8Q8VD72 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ttc8Q8VD72 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ttc8Q8VD72 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ttc8Q8VD72 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ttc8Q8VD72 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ttc8Q8VD72 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ttc8Q8VD72 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ttc8Q8VD72 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ttc8Q8VD72 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ttc8Q8VD72 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ttc8Q8VD72 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ttc8Q8VD72 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ttc8Q8VD72 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ttc8Q8VD72 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ttc8Q8VD72 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ttc8Q8VD72 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ttc8Q8VD72 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ttc8Q8VD72 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ttc8Q8VD72 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ttc8Q8VD72 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ttc8Q8VD72 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ttc8Q8VD72 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ttc8Q8VD72 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ttc8Q8VD72 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ttc8Q8VD72 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ttc8Q8VD72 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ttc8Q8VD72 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ttc8Q8VD72 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ttc8Q8VD72 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ttc8Q8VD72 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ttc8Q8VD72 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ttc8Q8VD72 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ttc8Q8VD72 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ttc8Q8VD72 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ttc8Q8VD72 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Ttc8Q8VD72 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ttc8Q8VD72 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ttc8Q8VD72 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ttc8Q8VD72 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ttc8Q8VD72 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ttc8Q8VD72 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ttc8Q8VD72 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ttc8Q8VD72 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ttc8Q8VD72 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ttc8Q8VD72 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ttc8Q8VD72 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ttc8Q8VD72 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ttc8Q8VD72 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ttc8Q8VD72 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ttc8Q8VD72 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ttc8Q8VD72 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ttc8Q8VD72 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ttc8Q8VD72 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ttc8Q8VD72 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ttc8Q8VD72 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ttc8Q8VD72 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ttc8Q8VD72 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ttc8Q8VD72 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ttc8Q8VD72 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ttc8Q8VD72 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ttc8Q8VD72 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ttc8Q8VD72 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ttc8Q8VD72 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ttc8Q8VD72 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ttc8Q8VD72 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ttc8Q8VD72 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ttc8Q8VD72 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ttc8Q8VD72 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ttc8Q8VD72 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ttc8Q8VD72 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ttc8Q8VD72 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ttc8Q8VD72 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ttc8Q8VD72 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ttc8Q8VD72 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ttc8Q8VD72 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ttc8Q8VD72 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ttc8Q8VD72 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ttc8Q8VD72 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ttc8Q8VD72 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ttc8Q8VD72 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ttc8Q8VD72 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ttc8Q8VD72 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ttc8Q8VD72 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ttc8Q8VD72 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ttc8Q8VD72 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ttc8Q8VD72 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ttc8Q8VD72 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ttc8Q8VD72 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ttc8Q8VD72 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ttc8Q8VD72 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ttc8Q8VD72 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ttc8Q8VD72 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms