Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ubxn4Q8VCH8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ubxn4Q8VCH8 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ubxn4Q8VCH8 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ubxn4Q8VCH8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ubxn4Q8VCH8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ubxn4Q8VCH8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ubxn4Q8VCH8 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ubxn4Q8VCH8 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ubxn4Q8VCH8 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ubxn4Q8VCH8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ubxn4Q8VCH8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ubxn4Q8VCH8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ubxn4Q8VCH8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ubxn4Q8VCH8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ubxn4Q8VCH8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ubxn4Q8VCH8 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ubxn4Q8VCH8 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ubxn4Q8VCH8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ubxn4Q8VCH8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ubxn4Q8VCH8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ubxn4Q8VCH8 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ubxn4Q8VCH8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ubxn4Q8VCH8 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ubxn4Q8VCH8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ubxn4Q8VCH8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ubxn4Q8VCH8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ubxn4Q8VCH8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ubxn4Q8VCH8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ubxn4Q8VCH8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ubxn4Q8VCH8 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ubxn4Q8VCH8 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ubxn4Q8VCH8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ubxn4Q8VCH8 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ubxn4Q8VCH8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ubxn4Q8VCH8 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ubxn4Q8VCH8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ubxn4Q8VCH8 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ubxn4Q8VCH8 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ubxn4Q8VCH8 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ubxn4Q8VCH8 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ubxn4Q8VCH8 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ubxn4Q8VCH8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ubxn4Q8VCH8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ubxn4Q8VCH8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ubxn4Q8VCH8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ubxn4Q8VCH8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ubxn4Q8VCH8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ubxn4Q8VCH8 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ubxn4Q8VCH8 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ubxn4Q8VCH8 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ubxn4Q8VCH8 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ubxn4Q8VCH8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ubxn4Q8VCH8 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ubxn4Q8VCH8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ubxn4Q8VCH8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ubxn4Q8VCH8 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ubxn4Q8VCH8 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ubxn4Q8VCH8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ubxn4Q8VCH8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ubxn4Q8VCH8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ubxn4Q8VCH8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ubxn4Q8VCH8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ubxn4Q8VCH8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ubxn4Q8VCH8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ubxn4Q8VCH8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ubxn4Q8VCH8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ubxn4Q8VCH8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ubxn4Q8VCH8 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ubxn4Q8VCH8 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ubxn4Q8VCH8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ubxn4Q8VCH8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ubxn4Q8VCH8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ubxn4Q8VCH8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ubxn4Q8VCH8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ubxn4Q8VCH8 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ubxn4Q8VCH8 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ubxn4Q8VCH8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ubxn4Q8VCH8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ubxn4Q8VCH8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ubxn4Q8VCH8 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ubxn4Q8VCH8 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ubxn4Q8VCH8 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ubxn4Q8VCH8 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ubxn4Q8VCH8 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ubxn4Q8VCH8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ubxn4Q8VCH8 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ubxn4Q8VCH8 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ubxn4Q8VCH8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ubxn4Q8VCH8 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ubxn4Q8VCH8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ubxn4Q8VCH8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ubxn4Q8VCH8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ubxn4Q8VCH8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ubxn4Q8VCH8 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ubxn4Q8VCH8 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ubxn4Q8VCH8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ubxn4Q8VCH8 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ubxn4Q8VCH8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ubxn4Q8VCH8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms