Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW5

Bbx, HMG box transcription factor BBX, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BbxQ8VBW5 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BbxQ8VBW5 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BbxQ8VBW5 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BbxQ8VBW5 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BbxQ8VBW5 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
BbxQ8VBW5 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
BbxQ8VBW5 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BbxQ8VBW5 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BbxQ8VBW5 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
BbxQ8VBW5 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BbxQ8VBW5 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BbxQ8VBW5 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BbxQ8VBW5 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
BbxQ8VBW5 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BbxQ8VBW5 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BbxQ8VBW5 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BbxQ8VBW5 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BbxQ8VBW5 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BbxQ8VBW5 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BbxQ8VBW5 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BbxQ8VBW5 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BbxQ8VBW5 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BbxQ8VBW5 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BbxQ8VBW5 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BbxQ8VBW5 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BbxQ8VBW5 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BbxQ8VBW5 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BbxQ8VBW5 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
BbxQ8VBW5 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
BbxQ8VBW5 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
BbxQ8VBW5 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
BbxQ8VBW5 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
BbxQ8VBW5 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BbxQ8VBW5 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
BbxQ8VBW5 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BbxQ8VBW5 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
BbxQ8VBW5 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BbxQ8VBW5 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BbxQ8VBW5 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BbxQ8VBW5 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BbxQ8VBW5 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BbxQ8VBW5 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BbxQ8VBW5 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BbxQ8VBW5 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
BbxQ8VBW5 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BbxQ8VBW5 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BbxQ8VBW5 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BbxQ8VBW5 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BbxQ8VBW5 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BbxQ8VBW5 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BbxQ8VBW5 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BbxQ8VBW5 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BbxQ8VBW5 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BbxQ8VBW5 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
BbxQ8VBW5 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BbxQ8VBW5 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BbxQ8VBW5 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
BbxQ8VBW5 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BbxQ8VBW5 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BbxQ8VBW5 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BbxQ8VBW5 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
BbxQ8VBW5 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BbxQ8VBW5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BbxQ8VBW5 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BbxQ8VBW5 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
BbxQ8VBW5 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
BbxQ8VBW5 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BbxQ8VBW5 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BbxQ8VBW5 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BbxQ8VBW5 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BbxQ8VBW5 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BbxQ8VBW5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BbxQ8VBW5 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BbxQ8VBW5 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BbxQ8VBW5 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BbxQ8VBW5 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BbxQ8VBW5 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BbxQ8VBW5 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BbxQ8VBW5 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BbxQ8VBW5 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BbxQ8VBW5 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BbxQ8VBW5 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BbxQ8VBW5 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BbxQ8VBW5 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BbxQ8VBW5 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BbxQ8VBW5 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BbxQ8VBW5 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BbxQ8VBW5 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
BbxQ8VBW5 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BbxQ8VBW5 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BbxQ8VBW5 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BbxQ8VBW5 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BbxQ8VBW5 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BbxQ8VBW5 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BbxQ8VBW5 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BbxQ8VBW5 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BbxQ8VBW5 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BbxQ8VBW5 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BbxQ8VBW5 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BbxQ8VBW5 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms