Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4R6

Nup35, Nucleoporin NUP53, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup35Q8R4R6 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup35Q8R4R6 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup35Q8R4R6 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup35Q8R4R6 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup35Q8R4R6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup35Q8R4R6 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup35Q8R4R6 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup35Q8R4R6 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup35Q8R4R6 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup35Q8R4R6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup35Q8R4R6 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup35Q8R4R6 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup35Q8R4R6 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup35Q8R4R6 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup35Q8R4R6 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup35Q8R4R6 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup35Q8R4R6 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup35Q8R4R6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup35Q8R4R6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup35Q8R4R6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup35Q8R4R6 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup35Q8R4R6 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup35Q8R4R6 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup35Q8R4R6 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup35Q8R4R6 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup35Q8R4R6 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup35Q8R4R6 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup35Q8R4R6 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup35Q8R4R6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nup35Q8R4R6 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nup35Q8R4R6 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nup35Q8R4R6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nup35Q8R4R6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nup35Q8R4R6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nup35Q8R4R6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nup35Q8R4R6 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nup35Q8R4R6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nup35Q8R4R6 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nup35Q8R4R6 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nup35Q8R4R6 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nup35Q8R4R6 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nup35Q8R4R6 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup35Q8R4R6 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup35Q8R4R6 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup35Q8R4R6 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup35Q8R4R6 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup35Q8R4R6 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup35Q8R4R6 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup35Q8R4R6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup35Q8R4R6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup35Q8R4R6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup35Q8R4R6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup35Q8R4R6 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup35Q8R4R6 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup35Q8R4R6 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup35Q8R4R6 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup35Q8R4R6 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup35Q8R4R6 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup35Q8R4R6 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup35Q8R4R6 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup35Q8R4R6 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup35Q8R4R6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup35Q8R4R6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup35Q8R4R6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup35Q8R4R6 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup35Q8R4R6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup35Q8R4R6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup35Q8R4R6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup35Q8R4R6 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup35Q8R4R6 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup35Q8R4R6 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup35Q8R4R6 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup35Q8R4R6 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup35Q8R4R6 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup35Q8R4R6 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup35Q8R4R6 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup35Q8R4R6 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup35Q8R4R6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup35Q8R4R6 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup35Q8R4R6 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup35Q8R4R6 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup35Q8R4R6 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup35Q8R4R6 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup35Q8R4R6 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup35Q8R4R6 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup35Q8R4R6 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup35Q8R4R6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup35Q8R4R6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup35Q8R4R6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup35Q8R4R6 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup35Q8R4R6 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup35Q8R4R6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup35Q8R4R6 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup35Q8R4R6 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup35Q8R4R6 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup35Q8R4R6 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup35Q8R4R6 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nup35Q8R4R6 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup35Q8R4R6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nup35Q8R4R6 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms