Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z4

Ncapd2, Condensin complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd2Q8K2Z4 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ncapd2Q8K2Z4 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ncapd2Q8K2Z4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ncapd2Q8K2Z4 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ncapd2Q8K2Z4 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ncapd2Q8K2Z4 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ncapd2Q8K2Z4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ncapd2Q8K2Z4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ncapd2Q8K2Z4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ncapd2Q8K2Z4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ncapd2Q8K2Z4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ncapd2Q8K2Z4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ncapd2Q8K2Z4 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Ncapd2Q8K2Z4 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ncapd2Q8K2Z4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ncapd2Q8K2Z4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ncapd2Q8K2Z4 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ncapd2Q8K2Z4 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ncapd2Q8K2Z4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ncapd2Q8K2Z4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ncapd2Q8K2Z4 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ncapd2Q8K2Z4 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Ncapd2Q8K2Z4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ncapd2Q8K2Z4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ncapd2Q8K2Z4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Ncapd2Q8K2Z4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ncapd2Q8K2Z4 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ncapd2Q8K2Z4 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ncapd2Q8K2Z4 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ncapd2Q8K2Z4 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ncapd2Q8K2Z4 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Ncapd2Q8K2Z4 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ncapd2Q8K2Z4 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ncapd2Q8K2Z4 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ncapd2Q8K2Z4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ncapd2Q8K2Z4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Ncapd2Q8K2Z4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Ncapd2Q8K2Z4 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ncapd2Q8K2Z4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ncapd2Q8K2Z4 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Ncapd2Q8K2Z4 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Ncapd2Q8K2Z4 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ncapd2Q8K2Z4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ncapd2Q8K2Z4 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Ncapd2Q8K2Z4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ncapd2Q8K2Z4 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ncapd2Q8K2Z4 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ncapd2Q8K2Z4 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Ncapd2Q8K2Z4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ncapd2Q8K2Z4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ncapd2Q8K2Z4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ncapd2Q8K2Z4 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ncapd2Q8K2Z4 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Ncapd2Q8K2Z4 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ncapd2Q8K2Z4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ncapd2Q8K2Z4 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ncapd2Q8K2Z4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ncapd2Q8K2Z4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ncapd2Q8K2Z4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ncapd2Q8K2Z4 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ncapd2Q8K2Z4 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ncapd2Q8K2Z4 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ncapd2Q8K2Z4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ncapd2Q8K2Z4 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Ncapd2Q8K2Z4 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ncapd2Q8K2Z4 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ncapd2Q8K2Z4 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ncapd2Q8K2Z4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ncapd2Q8K2Z4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ncapd2Q8K2Z4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ncapd2Q8K2Z4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ncapd2Q8K2Z4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ncapd2Q8K2Z4 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ncapd2Q8K2Z4 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ncapd2Q8K2Z4 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ncapd2Q8K2Z4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ncapd2Q8K2Z4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ncapd2Q8K2Z4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ncapd2Q8K2Z4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ncapd2Q8K2Z4 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ncapd2Q8K2Z4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ncapd2Q8K2Z4 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ncapd2Q8K2Z4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ncapd2Q8K2Z4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ncapd2Q8K2Z4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ncapd2Q8K2Z4 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ncapd2Q8K2Z4 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ncapd2Q8K2Z4 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ncapd2Q8K2Z4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ncapd2Q8K2Z4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ncapd2Q8K2Z4 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ncapd2Q8K2Z4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ncapd2Q8K2Z4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ncapd2Q8K2Z4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ncapd2Q8K2Z4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ncapd2Q8K2Z4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ncapd2Q8K2Z4 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ncapd2Q8K2Z4 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ncapd2Q8K2Z4 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ncapd2Q8K2Z4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms