Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Y9

Ccm2, Cerebral cavernous malformations protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccm2Q8K2Y9 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccm2Q8K2Y9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccm2Q8K2Y9 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccm2Q8K2Y9 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccm2Q8K2Y9 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccm2Q8K2Y9 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccm2Q8K2Y9 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccm2Q8K2Y9 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccm2Q8K2Y9 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccm2Q8K2Y9 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccm2Q8K2Y9 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccm2Q8K2Y9 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccm2Q8K2Y9 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccm2Q8K2Y9 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccm2Q8K2Y9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccm2Q8K2Y9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccm2Q8K2Y9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccm2Q8K2Y9 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccm2Q8K2Y9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccm2Q8K2Y9 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccm2Q8K2Y9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccm2Q8K2Y9 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccm2Q8K2Y9 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccm2Q8K2Y9 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccm2Q8K2Y9 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccm2Q8K2Y9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccm2Q8K2Y9 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccm2Q8K2Y9 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccm2Q8K2Y9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccm2Q8K2Y9 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccm2Q8K2Y9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccm2Q8K2Y9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccm2Q8K2Y9 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccm2Q8K2Y9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccm2Q8K2Y9 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccm2Q8K2Y9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccm2Q8K2Y9 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccm2Q8K2Y9 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccm2Q8K2Y9 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccm2Q8K2Y9 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccm2Q8K2Y9 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccm2Q8K2Y9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccm2Q8K2Y9 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccm2Q8K2Y9 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccm2Q8K2Y9 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccm2Q8K2Y9 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccm2Q8K2Y9 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccm2Q8K2Y9 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccm2Q8K2Y9 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccm2Q8K2Y9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccm2Q8K2Y9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccm2Q8K2Y9 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccm2Q8K2Y9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccm2Q8K2Y9 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccm2Q8K2Y9 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccm2Q8K2Y9 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccm2Q8K2Y9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccm2Q8K2Y9 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccm2Q8K2Y9 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccm2Q8K2Y9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccm2Q8K2Y9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccm2Q8K2Y9 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccm2Q8K2Y9 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccm2Q8K2Y9 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccm2Q8K2Y9 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccm2Q8K2Y9 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccm2Q8K2Y9 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccm2Q8K2Y9 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccm2Q8K2Y9 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccm2Q8K2Y9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccm2Q8K2Y9 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccm2Q8K2Y9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccm2Q8K2Y9 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccm2Q8K2Y9 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccm2Q8K2Y9 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccm2Q8K2Y9 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccm2Q8K2Y9 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccm2Q8K2Y9 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccm2Q8K2Y9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccm2Q8K2Y9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccm2Q8K2Y9 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccm2Q8K2Y9 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccm2Q8K2Y9 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccm2Q8K2Y9 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccm2Q8K2Y9 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccm2Q8K2Y9 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccm2Q8K2Y9 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccm2Q8K2Y9 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccm2Q8K2Y9 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccm2Q8K2Y9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccm2Q8K2Y9 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccm2Q8K2Y9 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccm2Q8K2Y9 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccm2Q8K2Y9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccm2Q8K2Y9 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccm2Q8K2Y9 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccm2Q8K2Y9 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccm2Q8K2Y9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccm2Q8K2Y9 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccm2Q8K2Y9 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms