Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sde2Q8K1J5 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sde2Q8K1J5 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sde2Q8K1J5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Sde2Q8K1J5 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Sde2Q8K1J5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sde2Q8K1J5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sde2Q8K1J5 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sde2Q8K1J5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sde2Q8K1J5 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sde2Q8K1J5 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Sde2Q8K1J5 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sde2Q8K1J5 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sde2Q8K1J5 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sde2Q8K1J5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sde2Q8K1J5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sde2Q8K1J5 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sde2Q8K1J5 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Sde2Q8K1J5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sde2Q8K1J5 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sde2Q8K1J5 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sde2Q8K1J5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sde2Q8K1J5 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sde2Q8K1J5 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sde2Q8K1J5 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sde2Q8K1J5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sde2Q8K1J5 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sde2Q8K1J5 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sde2Q8K1J5 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Sde2Q8K1J5 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sde2Q8K1J5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sde2Q8K1J5 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sde2Q8K1J5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sde2Q8K1J5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sde2Q8K1J5 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sde2Q8K1J5 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sde2Q8K1J5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sde2Q8K1J5 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sde2Q8K1J5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sde2Q8K1J5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sde2Q8K1J5 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sde2Q8K1J5 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sde2Q8K1J5 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sde2Q8K1J5 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sde2Q8K1J5 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Sde2Q8K1J5 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sde2Q8K1J5 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sde2Q8K1J5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sde2Q8K1J5 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sde2Q8K1J5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sde2Q8K1J5 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sde2Q8K1J5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Sde2Q8K1J5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Sde2Q8K1J5 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sde2Q8K1J5 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sde2Q8K1J5 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sde2Q8K1J5 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sde2Q8K1J5 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sde2Q8K1J5 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sde2Q8K1J5 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sde2Q8K1J5 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sde2Q8K1J5 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sde2Q8K1J5 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sde2Q8K1J5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sde2Q8K1J5 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sde2Q8K1J5 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sde2Q8K1J5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sde2Q8K1J5 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sde2Q8K1J5 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Sde2Q8K1J5 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sde2Q8K1J5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sde2Q8K1J5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sde2Q8K1J5 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sde2Q8K1J5 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sde2Q8K1J5 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sde2Q8K1J5 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sde2Q8K1J5 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sde2Q8K1J5 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sde2Q8K1J5 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sde2Q8K1J5 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sde2Q8K1J5 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sde2Q8K1J5 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sde2Q8K1J5 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sde2Q8K1J5 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sde2Q8K1J5 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sde2Q8K1J5 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sde2Q8K1J5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sde2Q8K1J5 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sde2Q8K1J5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sde2Q8K1J5 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sde2Q8K1J5 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sde2Q8K1J5 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sde2Q8K1J5 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sde2Q8K1J5 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sde2Q8K1J5 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sde2Q8K1J5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sde2Q8K1J5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sde2Q8K1J5 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sde2Q8K1J5 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sde2Q8K1J5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms