Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FgbQ8K0E8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FgbQ8K0E8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FgbQ8K0E8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FgbQ8K0E8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FgbQ8K0E8 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FgbQ8K0E8 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FgbQ8K0E8 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
FgbQ8K0E8 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FgbQ8K0E8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FgbQ8K0E8 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FgbQ8K0E8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FgbQ8K0E8 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FgbQ8K0E8 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FgbQ8K0E8 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FgbQ8K0E8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FgbQ8K0E8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FgbQ8K0E8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FgbQ8K0E8 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FgbQ8K0E8 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FgbQ8K0E8 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FgbQ8K0E8 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FgbQ8K0E8 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FgbQ8K0E8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FgbQ8K0E8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FgbQ8K0E8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FgbQ8K0E8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FgbQ8K0E8 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FgbQ8K0E8 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
FgbQ8K0E8 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FgbQ8K0E8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FgbQ8K0E8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FgbQ8K0E8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FgbQ8K0E8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FgbQ8K0E8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FgbQ8K0E8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FgbQ8K0E8 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FgbQ8K0E8 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FgbQ8K0E8 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FgbQ8K0E8 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FgbQ8K0E8 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FgbQ8K0E8 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FgbQ8K0E8 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
FgbQ8K0E8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FgbQ8K0E8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FgbQ8K0E8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FgbQ8K0E8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FgbQ8K0E8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FgbQ8K0E8 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FgbQ8K0E8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FgbQ8K0E8 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FgbQ8K0E8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FgbQ8K0E8 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FgbQ8K0E8 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FgbQ8K0E8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FgbQ8K0E8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FgbQ8K0E8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FgbQ8K0E8 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FgbQ8K0E8 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FgbQ8K0E8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FgbQ8K0E8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FgbQ8K0E8 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FgbQ8K0E8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FgbQ8K0E8 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FgbQ8K0E8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FgbQ8K0E8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FgbQ8K0E8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FgbQ8K0E8 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
FgbQ8K0E8 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FgbQ8K0E8 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FgbQ8K0E8 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FgbQ8K0E8 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FgbQ8K0E8 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FgbQ8K0E8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FgbQ8K0E8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FgbQ8K0E8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FgbQ8K0E8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
FgbQ8K0E8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FgbQ8K0E8 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
FgbQ8K0E8 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
FgbQ8K0E8 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
FgbQ8K0E8 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
FgbQ8K0E8 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FgbQ8K0E8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FgbQ8K0E8 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FgbQ8K0E8 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FgbQ8K0E8 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FgbQ8K0E8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FgbQ8K0E8 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FgbQ8K0E8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FgbQ8K0E8 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FgbQ8K0E8 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FgbQ8K0E8 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FgbQ8K0E8 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FgbQ8K0E8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FgbQ8K0E8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FgbQ8K0E8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FgbQ8K0E8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FgbQ8K0E8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FgbQ8K0E8 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms