Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0B2

Lmbrd1, Probable lysosomal cobalamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbrd1Q8K0B2 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lmbrd1Q8K0B2 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lmbrd1Q8K0B2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lmbrd1Q8K0B2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lmbrd1Q8K0B2 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lmbrd1Q8K0B2 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lmbrd1Q8K0B2 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lmbrd1Q8K0B2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lmbrd1Q8K0B2 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lmbrd1Q8K0B2 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lmbrd1Q8K0B2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lmbrd1Q8K0B2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lmbrd1Q8K0B2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lmbrd1Q8K0B2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lmbrd1Q8K0B2 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lmbrd1Q8K0B2 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lmbrd1Q8K0B2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lmbrd1Q8K0B2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lmbrd1Q8K0B2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lmbrd1Q8K0B2 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lmbrd1Q8K0B2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lmbrd1Q8K0B2 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lmbrd1Q8K0B2 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lmbrd1Q8K0B2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lmbrd1Q8K0B2 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lmbrd1Q8K0B2 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lmbrd1Q8K0B2 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lmbrd1Q8K0B2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lmbrd1Q8K0B2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lmbrd1Q8K0B2 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lmbrd1Q8K0B2 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lmbrd1Q8K0B2 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lmbrd1Q8K0B2 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lmbrd1Q8K0B2 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lmbrd1Q8K0B2 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lmbrd1Q8K0B2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lmbrd1Q8K0B2 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lmbrd1Q8K0B2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lmbrd1Q8K0B2 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lmbrd1Q8K0B2 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lmbrd1Q8K0B2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lmbrd1Q8K0B2 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lmbrd1Q8K0B2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lmbrd1Q8K0B2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lmbrd1Q8K0B2 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lmbrd1Q8K0B2 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lmbrd1Q8K0B2 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lmbrd1Q8K0B2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lmbrd1Q8K0B2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lmbrd1Q8K0B2 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Lmbrd1Q8K0B2 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Lmbrd1Q8K0B2 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lmbrd1Q8K0B2 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Lmbrd1Q8K0B2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lmbrd1Q8K0B2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lmbrd1Q8K0B2 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lmbrd1Q8K0B2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lmbrd1Q8K0B2 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lmbrd1Q8K0B2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lmbrd1Q8K0B2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lmbrd1Q8K0B2 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lmbrd1Q8K0B2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lmbrd1Q8K0B2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lmbrd1Q8K0B2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lmbrd1Q8K0B2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lmbrd1Q8K0B2 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lmbrd1Q8K0B2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lmbrd1Q8K0B2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lmbrd1Q8K0B2 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lmbrd1Q8K0B2 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lmbrd1Q8K0B2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lmbrd1Q8K0B2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lmbrd1Q8K0B2 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lmbrd1Q8K0B2 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lmbrd1Q8K0B2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lmbrd1Q8K0B2 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lmbrd1Q8K0B2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lmbrd1Q8K0B2 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lmbrd1Q8K0B2 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lmbrd1Q8K0B2 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lmbrd1Q8K0B2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lmbrd1Q8K0B2 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lmbrd1Q8K0B2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lmbrd1Q8K0B2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lmbrd1Q8K0B2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lmbrd1Q8K0B2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lmbrd1Q8K0B2 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lmbrd1Q8K0B2 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lmbrd1Q8K0B2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Lmbrd1Q8K0B2 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lmbrd1Q8K0B2 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lmbrd1Q8K0B2 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lmbrd1Q8K0B2 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lmbrd1Q8K0B2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lmbrd1Q8K0B2 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lmbrd1Q8K0B2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lmbrd1Q8K0B2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lmbrd1Q8K0B2 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lmbrd1Q8K0B2 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lmbrd1Q8K0B2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms