Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH77

Nav1, Neuron navigator 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nav1Q8CH77 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nav1Q8CH77 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nav1Q8CH77 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Nav1Q8CH77 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nav1Q8CH77 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nav1Q8CH77 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nav1Q8CH77 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nav1Q8CH77 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nav1Q8CH77 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nav1Q8CH77 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nav1Q8CH77 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nav1Q8CH77 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nav1Q8CH77 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Nav1Q8CH77 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nav1Q8CH77 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nav1Q8CH77 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nav1Q8CH77 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Nav1Q8CH77 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nav1Q8CH77 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nav1Q8CH77 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Nav1Q8CH77 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nav1Q8CH77 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nav1Q8CH77 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nav1Q8CH77 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nav1Q8CH77 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nav1Q8CH77 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nav1Q8CH77 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Nav1Q8CH77 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nav1Q8CH77 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nav1Q8CH77 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nav1Q8CH77 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nav1Q8CH77 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nav1Q8CH77 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nav1Q8CH77 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nav1Q8CH77 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nav1Q8CH77 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nav1Q8CH77 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nav1Q8CH77 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nav1Q8CH77 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nav1Q8CH77 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nav1Q8CH77 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nav1Q8CH77 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Nav1Q8CH77 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nav1Q8CH77 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nav1Q8CH77 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nav1Q8CH77 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nav1Q8CH77 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nav1Q8CH77 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nav1Q8CH77 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nav1Q8CH77 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nav1Q8CH77 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nav1Q8CH77 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nav1Q8CH77 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nav1Q8CH77 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nav1Q8CH77 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nav1Q8CH77 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nav1Q8CH77 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Nav1Q8CH77 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nav1Q8CH77 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nav1Q8CH77 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nav1Q8CH77 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nav1Q8CH77 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nav1Q8CH77 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nav1Q8CH77 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nav1Q8CH77 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nav1Q8CH77 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nav1Q8CH77 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nav1Q8CH77 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Nav1Q8CH77 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Nav1Q8CH77 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Nav1Q8CH77 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nav1Q8CH77 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nav1Q8CH77 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nav1Q8CH77 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nav1Q8CH77 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nav1Q8CH77 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nav1Q8CH77 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nav1Q8CH77 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nav1Q8CH77 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nav1Q8CH77 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nav1Q8CH77 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Nav1Q8CH77 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nav1Q8CH77 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nav1Q8CH77 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nav1Q8CH77 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nav1Q8CH77 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nav1Q8CH77 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nav1Q8CH77 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nav1Q8CH77 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nav1Q8CH77 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nav1Q8CH77 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nav1Q8CH77 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nav1Q8CH77 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nav1Q8CH77 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nav1Q8CH77 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nav1Q8CH77 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nav1Q8CH77 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Nav1Q8CH77 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nav1Q8CH77 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nav1Q8CH77 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms