Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atg4aQ8C9S8 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atg4aQ8C9S8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atg4aQ8C9S8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atg4aQ8C9S8 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Atg4aQ8C9S8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atg4aQ8C9S8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atg4aQ8C9S8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atg4aQ8C9S8 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atg4aQ8C9S8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atg4aQ8C9S8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atg4aQ8C9S8 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atg4aQ8C9S8 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atg4aQ8C9S8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atg4aQ8C9S8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atg4aQ8C9S8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atg4aQ8C9S8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atg4aQ8C9S8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atg4aQ8C9S8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Atg4aQ8C9S8 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atg4aQ8C9S8 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atg4aQ8C9S8 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atg4aQ8C9S8 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atg4aQ8C9S8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atg4aQ8C9S8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atg4aQ8C9S8 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atg4aQ8C9S8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Atg4aQ8C9S8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Atg4aQ8C9S8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Atg4aQ8C9S8 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Atg4aQ8C9S8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Atg4aQ8C9S8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atg4aQ8C9S8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atg4aQ8C9S8 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atg4aQ8C9S8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atg4aQ8C9S8 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atg4aQ8C9S8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atg4aQ8C9S8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Atg4aQ8C9S8 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atg4aQ8C9S8 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atg4aQ8C9S8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atg4aQ8C9S8 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Atg4aQ8C9S8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atg4aQ8C9S8 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atg4aQ8C9S8 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atg4aQ8C9S8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atg4aQ8C9S8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atg4aQ8C9S8 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atg4aQ8C9S8 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atg4aQ8C9S8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atg4aQ8C9S8 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atg4aQ8C9S8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atg4aQ8C9S8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atg4aQ8C9S8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atg4aQ8C9S8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atg4aQ8C9S8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atg4aQ8C9S8 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atg4aQ8C9S8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atg4aQ8C9S8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atg4aQ8C9S8 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atg4aQ8C9S8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atg4aQ8C9S8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atg4aQ8C9S8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atg4aQ8C9S8 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atg4aQ8C9S8 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Atg4aQ8C9S8 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atg4aQ8C9S8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atg4aQ8C9S8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atg4aQ8C9S8 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atg4aQ8C9S8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atg4aQ8C9S8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atg4aQ8C9S8 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Atg4aQ8C9S8 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atg4aQ8C9S8 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atg4aQ8C9S8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atg4aQ8C9S8 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atg4aQ8C9S8 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atg4aQ8C9S8 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atg4aQ8C9S8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atg4aQ8C9S8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atg4aQ8C9S8 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atg4aQ8C9S8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atg4aQ8C9S8 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atg4aQ8C9S8 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Atg4aQ8C9S8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atg4aQ8C9S8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atg4aQ8C9S8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atg4aQ8C9S8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Atg4aQ8C9S8 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atg4aQ8C9S8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atg4aQ8C9S8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atg4aQ8C9S8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atg4aQ8C9S8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atg4aQ8C9S8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atg4aQ8C9S8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atg4aQ8C9S8 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Atg4aQ8C9S8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atg4aQ8C9S8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Atg4aQ8C9S8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Atg4aQ8C9S8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
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