Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc113Q8C5T8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc113Q8C5T8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc113Q8C5T8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc113Q8C5T8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc113Q8C5T8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc113Q8C5T8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc113Q8C5T8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc113Q8C5T8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc113Q8C5T8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc113Q8C5T8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc113Q8C5T8 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc113Q8C5T8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc113Q8C5T8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc113Q8C5T8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc113Q8C5T8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc113Q8C5T8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc113Q8C5T8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc113Q8C5T8 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc113Q8C5T8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc113Q8C5T8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc113Q8C5T8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc113Q8C5T8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc113Q8C5T8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccdc113Q8C5T8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc113Q8C5T8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc113Q8C5T8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc113Q8C5T8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc113Q8C5T8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc113Q8C5T8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc113Q8C5T8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc113Q8C5T8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc113Q8C5T8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc113Q8C5T8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc113Q8C5T8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc113Q8C5T8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc113Q8C5T8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc113Q8C5T8 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc113Q8C5T8 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc113Q8C5T8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc113Q8C5T8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc113Q8C5T8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc113Q8C5T8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc113Q8C5T8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc113Q8C5T8 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc113Q8C5T8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc113Q8C5T8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc113Q8C5T8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc113Q8C5T8 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc113Q8C5T8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc113Q8C5T8 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc113Q8C5T8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc113Q8C5T8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc113Q8C5T8 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc113Q8C5T8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc113Q8C5T8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc113Q8C5T8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc113Q8C5T8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc113Q8C5T8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc113Q8C5T8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc113Q8C5T8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc113Q8C5T8 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc113Q8C5T8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc113Q8C5T8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc113Q8C5T8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc113Q8C5T8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc113Q8C5T8 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc113Q8C5T8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc113Q8C5T8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc113Q8C5T8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc113Q8C5T8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc113Q8C5T8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc113Q8C5T8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc113Q8C5T8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc113Q8C5T8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc113Q8C5T8 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc113Q8C5T8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc113Q8C5T8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc113Q8C5T8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc113Q8C5T8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc113Q8C5T8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ccdc113Q8C5T8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ccdc113Q8C5T8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ccdc113Q8C5T8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc113Q8C5T8 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc113Q8C5T8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc113Q8C5T8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc113Q8C5T8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc113Q8C5T8 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc113Q8C5T8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc113Q8C5T8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc113Q8C5T8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc113Q8C5T8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc113Q8C5T8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc113Q8C5T8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc113Q8C5T8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc113Q8C5T8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc113Q8C5T8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc113Q8C5T8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc113Q8C5T8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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