Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0M8

Dnai1, Dynein intermediate chain 1, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnai1Q8C0M8 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dnai1Q8C0M8 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dnai1Q8C0M8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Dnai1Q8C0M8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dnai1Q8C0M8 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dnai1Q8C0M8 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dnai1Q8C0M8 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dnai1Q8C0M8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dnai1Q8C0M8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dnai1Q8C0M8 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dnai1Q8C0M8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dnai1Q8C0M8 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dnai1Q8C0M8 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dnai1Q8C0M8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dnai1Q8C0M8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dnai1Q8C0M8 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dnai1Q8C0M8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dnai1Q8C0M8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dnai1Q8C0M8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dnai1Q8C0M8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dnai1Q8C0M8 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dnai1Q8C0M8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dnai1Q8C0M8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dnai1Q8C0M8 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dnai1Q8C0M8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dnai1Q8C0M8 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Dnai1Q8C0M8 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dnai1Q8C0M8 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dnai1Q8C0M8 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dnai1Q8C0M8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dnai1Q8C0M8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dnai1Q8C0M8 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Dnai1Q8C0M8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dnai1Q8C0M8 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dnai1Q8C0M8 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dnai1Q8C0M8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dnai1Q8C0M8 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dnai1Q8C0M8 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dnai1Q8C0M8 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Dnai1Q8C0M8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dnai1Q8C0M8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dnai1Q8C0M8 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dnai1Q8C0M8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dnai1Q8C0M8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dnai1Q8C0M8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Dnai1Q8C0M8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dnai1Q8C0M8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dnai1Q8C0M8 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dnai1Q8C0M8 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dnai1Q8C0M8 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dnai1Q8C0M8 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dnai1Q8C0M8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dnai1Q8C0M8 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dnai1Q8C0M8 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dnai1Q8C0M8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dnai1Q8C0M8 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dnai1Q8C0M8 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dnai1Q8C0M8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dnai1Q8C0M8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dnai1Q8C0M8 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dnai1Q8C0M8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Dnai1Q8C0M8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Dnai1Q8C0M8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Dnai1Q8C0M8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Dnai1Q8C0M8 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Dnai1Q8C0M8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Dnai1Q8C0M8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Dnai1Q8C0M8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Dnai1Q8C0M8 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Dnai1Q8C0M8 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Dnai1Q8C0M8 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Dnai1Q8C0M8 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
Dnai1Q8C0M8 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
Dnai1Q8C0M8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Dnai1Q8C0M8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Dnai1Q8C0M8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Dnai1Q8C0M8 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Dnai1Q8C0M8 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Dnai1Q8C0M8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Dnai1Q8C0M8 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dnai1Q8C0M8 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dnai1Q8C0M8 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dnai1Q8C0M8 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dnai1Q8C0M8 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dnai1Q8C0M8 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dnai1Q8C0M8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dnai1Q8C0M8 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Dnai1Q8C0M8 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dnai1Q8C0M8 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dnai1Q8C0M8 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dnai1Q8C0M8 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dnai1Q8C0M8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Dnai1Q8C0M8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dnai1Q8C0M8 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dnai1Q8C0M8 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dnai1Q8C0M8 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dnai1Q8C0M8 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dnai1Q8C0M8 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Dnai1Q8C0M8 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dnai1Q8C0M8 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms