Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX22

Sall4, Sal-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,067 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall4Q8BX22 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Sall4Q8BX22 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sall4Q8BX22 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sall4Q8BX22 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sall4Q8BX22 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sall4Q8BX22 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sall4Q8BX22 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sall4Q8BX22 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Sall4Q8BX22 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sall4Q8BX22 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sall4Q8BX22 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sall4Q8BX22 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Sall4Q8BX22 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sall4Q8BX22 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sall4Q8BX22 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sall4Q8BX22 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sall4Q8BX22 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sall4Q8BX22 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sall4Q8BX22 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Sall4Q8BX22 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Sall4Q8BX22 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sall4Q8BX22 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sall4Q8BX22 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sall4Q8BX22 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sall4Q8BX22 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sall4Q8BX22 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sall4Q8BX22 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sall4Q8BX22 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sall4Q8BX22 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sall4Q8BX22 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sall4Q8BX22 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Sall4Q8BX22 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sall4Q8BX22 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sall4Q8BX22 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sall4Q8BX22 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sall4Q8BX22 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sall4Q8BX22 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sall4Q8BX22 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sall4Q8BX22 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sall4Q8BX22 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sall4Q8BX22 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sall4Q8BX22 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sall4Q8BX22 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sall4Q8BX22 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sall4Q8BX22 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sall4Q8BX22 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sall4Q8BX22 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sall4Q8BX22 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sall4Q8BX22 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sall4Q8BX22 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sall4Q8BX22 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sall4Q8BX22 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sall4Q8BX22 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sall4Q8BX22 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sall4Q8BX22 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sall4Q8BX22 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sall4Q8BX22 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sall4Q8BX22 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sall4Q8BX22 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sall4Q8BX22 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sall4Q8BX22 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sall4Q8BX22 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sall4Q8BX22 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sall4Q8BX22 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Sall4Q8BX22 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sall4Q8BX22 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sall4Q8BX22 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sall4Q8BX22 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sall4Q8BX22 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sall4Q8BX22 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sall4Q8BX22 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sall4Q8BX22 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sall4Q8BX22 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sall4Q8BX22 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Sall4Q8BX22 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sall4Q8BX22 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sall4Q8BX22 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sall4Q8BX22 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sall4Q8BX22 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sall4Q8BX22 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sall4Q8BX22 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Sall4Q8BX22 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sall4Q8BX22 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sall4Q8BX22 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sall4Q8BX22 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sall4Q8BX22 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Sall4Q8BX22 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sall4Q8BX22 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sall4Q8BX22 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sall4Q8BX22 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sall4Q8BX22 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sall4Q8BX22 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sall4Q8BX22 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sall4Q8BX22 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sall4Q8BX22 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sall4Q8BX22 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sall4Q8BX22 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sall4Q8BX22 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sall4Q8BX22 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sall4Q8BX22 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms