Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWP5

Ttpa, Alpha-tocopherol transfer protein, mousemouse

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtpaQ8BWP5 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TtpaQ8BWP5 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TtpaQ8BWP5 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TtpaQ8BWP5 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TtpaQ8BWP5 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TtpaQ8BWP5 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TtpaQ8BWP5 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TtpaQ8BWP5 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TtpaQ8BWP5 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TtpaQ8BWP5 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TtpaQ8BWP5 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TtpaQ8BWP5 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TtpaQ8BWP5 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TtpaQ8BWP5 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TtpaQ8BWP5 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TtpaQ8BWP5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TtpaQ8BWP5 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TtpaQ8BWP5 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TtpaQ8BWP5 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TtpaQ8BWP5 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TtpaQ8BWP5 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TtpaQ8BWP5 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TtpaQ8BWP5 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TtpaQ8BWP5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TtpaQ8BWP5 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TtpaQ8BWP5 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TtpaQ8BWP5 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TtpaQ8BWP5 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TtpaQ8BWP5 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TtpaQ8BWP5 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TtpaQ8BWP5 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TtpaQ8BWP5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TtpaQ8BWP5 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TtpaQ8BWP5 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TtpaQ8BWP5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TtpaQ8BWP5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TtpaQ8BWP5 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TtpaQ8BWP5 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TtpaQ8BWP5 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TtpaQ8BWP5 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TtpaQ8BWP5 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TtpaQ8BWP5 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TtpaQ8BWP5 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TtpaQ8BWP5 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TtpaQ8BWP5 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TtpaQ8BWP5 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TtpaQ8BWP5 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TtpaQ8BWP5 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TtpaQ8BWP5 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TtpaQ8BWP5 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TtpaQ8BWP5 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TtpaQ8BWP5 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TtpaQ8BWP5 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TtpaQ8BWP5 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TtpaQ8BWP5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TtpaQ8BWP5 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TtpaQ8BWP5 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TtpaQ8BWP5 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TtpaQ8BWP5 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TtpaQ8BWP5 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TtpaQ8BWP5 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TtpaQ8BWP5 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TtpaQ8BWP5 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TtpaQ8BWP5 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TtpaQ8BWP5 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TtpaQ8BWP5 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TtpaQ8BWP5 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TtpaQ8BWP5 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TtpaQ8BWP5 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TtpaQ8BWP5 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TtpaQ8BWP5 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TtpaQ8BWP5 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TtpaQ8BWP5 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TtpaQ8BWP5 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TtpaQ8BWP5 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TtpaQ8BWP5 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TtpaQ8BWP5 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TtpaQ8BWP5 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TtpaQ8BWP5 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TtpaQ8BWP5 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TtpaQ8BWP5 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TtpaQ8BWP5 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TtpaQ8BWP5 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TtpaQ8BWP5 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TtpaQ8BWP5 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TtpaQ8BWP5 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
TtpaQ8BWP5 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TtpaQ8BWP5 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TtpaQ8BWP5 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TtpaQ8BWP5 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TtpaQ8BWP5 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TtpaQ8BWP5 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TtpaQ8BWP5 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TtpaQ8BWP5 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
TtpaQ8BWP5 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TtpaQ8BWP5 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TtpaQ8BWP5 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TtpaQ8BWP5 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TtpaQ8BWP5 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
TtpaQ8BWP5 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms