Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVP1

Triml1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIML1, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Triml1Q8BVP1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Triml1Q8BVP1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Triml1Q8BVP1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Triml1Q8BVP1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Triml1Q8BVP1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Triml1Q8BVP1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Triml1Q8BVP1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Triml1Q8BVP1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Triml1Q8BVP1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Triml1Q8BVP1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Triml1Q8BVP1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Triml1Q8BVP1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Triml1Q8BVP1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Triml1Q8BVP1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Triml1Q8BVP1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Triml1Q8BVP1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Triml1Q8BVP1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Triml1Q8BVP1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Triml1Q8BVP1 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Triml1Q8BVP1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Triml1Q8BVP1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Triml1Q8BVP1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Triml1Q8BVP1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Triml1Q8BVP1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Triml1Q8BVP1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Triml1Q8BVP1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Triml1Q8BVP1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Triml1Q8BVP1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Triml1Q8BVP1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Triml1Q8BVP1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Triml1Q8BVP1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Triml1Q8BVP1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Triml1Q8BVP1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Triml1Q8BVP1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Triml1Q8BVP1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Triml1Q8BVP1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Triml1Q8BVP1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Triml1Q8BVP1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Triml1Q8BVP1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Triml1Q8BVP1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Triml1Q8BVP1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Triml1Q8BVP1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Triml1Q8BVP1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Triml1Q8BVP1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Triml1Q8BVP1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Triml1Q8BVP1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Triml1Q8BVP1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Triml1Q8BVP1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Triml1Q8BVP1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Triml1Q8BVP1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Triml1Q8BVP1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Triml1Q8BVP1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Triml1Q8BVP1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Triml1Q8BVP1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Triml1Q8BVP1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Triml1Q8BVP1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Triml1Q8BVP1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Triml1Q8BVP1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Triml1Q8BVP1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Triml1Q8BVP1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Triml1Q8BVP1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Triml1Q8BVP1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Triml1Q8BVP1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Triml1Q8BVP1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Triml1Q8BVP1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Triml1Q8BVP1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Triml1Q8BVP1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Triml1Q8BVP1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Triml1Q8BVP1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Triml1Q8BVP1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Triml1Q8BVP1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Triml1Q8BVP1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Triml1Q8BVP1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Triml1Q8BVP1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Triml1Q8BVP1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Triml1Q8BVP1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Triml1Q8BVP1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Triml1Q8BVP1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Triml1Q8BVP1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Triml1Q8BVP1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Triml1Q8BVP1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Triml1Q8BVP1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Triml1Q8BVP1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Triml1Q8BVP1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Triml1Q8BVP1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Triml1Q8BVP1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Triml1Q8BVP1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Triml1Q8BVP1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Triml1Q8BVP1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Triml1Q8BVP1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Triml1Q8BVP1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Triml1Q8BVP1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Triml1Q8BVP1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Triml1Q8BVP1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Triml1Q8BVP1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Triml1Q8BVP1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Triml1Q8BVP1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Triml1Q8BVP1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Triml1Q8BVP1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Triml1Q8BVP1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms