Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc172Q810N9 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccdc172Q810N9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc172Q810N9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc172Q810N9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc172Q810N9 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc172Q810N9 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc172Q810N9 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc172Q810N9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc172Q810N9 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc172Q810N9 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc172Q810N9 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccdc172Q810N9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc172Q810N9 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc172Q810N9 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc172Q810N9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc172Q810N9 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc172Q810N9 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc172Q810N9 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc172Q810N9 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc172Q810N9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc172Q810N9 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc172Q810N9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccdc172Q810N9 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc172Q810N9 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc172Q810N9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc172Q810N9 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc172Q810N9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc172Q810N9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc172Q810N9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc172Q810N9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc172Q810N9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc172Q810N9 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc172Q810N9 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ccdc172Q810N9 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc172Q810N9 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc172Q810N9 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc172Q810N9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc172Q810N9 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc172Q810N9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc172Q810N9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc172Q810N9 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccdc172Q810N9 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc172Q810N9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc172Q810N9 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc172Q810N9 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc172Q810N9 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc172Q810N9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc172Q810N9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc172Q810N9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc172Q810N9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc172Q810N9 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc172Q810N9 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc172Q810N9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc172Q810N9 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccdc172Q810N9 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc172Q810N9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc172Q810N9 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc172Q810N9 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc172Q810N9 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc172Q810N9 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc172Q810N9 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc172Q810N9 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc172Q810N9 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc172Q810N9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc172Q810N9 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc172Q810N9 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc172Q810N9 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc172Q810N9 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc172Q810N9 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc172Q810N9 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc172Q810N9 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc172Q810N9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc172Q810N9 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc172Q810N9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc172Q810N9 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc172Q810N9 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc172Q810N9 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc172Q810N9 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc172Q810N9 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ccdc172Q810N9 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc172Q810N9 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc172Q810N9 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc172Q810N9 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc172Q810N9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc172Q810N9 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc172Q810N9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc172Q810N9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc172Q810N9 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc172Q810N9 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc172Q810N9 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc172Q810N9 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc172Q810N9 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc172Q810N9 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc172Q810N9 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc172Q810N9 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc172Q810N9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc172Q810N9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc172Q810N9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc172Q810N9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms