Protein–RNA interactions for Protein: Q810L4

Tmem39b, Transmembrane protein 39B, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem39bQ810L4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmem39bQ810L4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmem39bQ810L4 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmem39bQ810L4 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmem39bQ810L4 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmem39bQ810L4 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmem39bQ810L4 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmem39bQ810L4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmem39bQ810L4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmem39bQ810L4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmem39bQ810L4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmem39bQ810L4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmem39bQ810L4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmem39bQ810L4 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmem39bQ810L4 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmem39bQ810L4 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmem39bQ810L4 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmem39bQ810L4 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmem39bQ810L4 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmem39bQ810L4 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmem39bQ810L4 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmem39bQ810L4 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmem39bQ810L4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmem39bQ810L4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmem39bQ810L4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmem39bQ810L4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmem39bQ810L4 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmem39bQ810L4 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmem39bQ810L4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmem39bQ810L4 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmem39bQ810L4 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmem39bQ810L4 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmem39bQ810L4 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmem39bQ810L4 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmem39bQ810L4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmem39bQ810L4 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmem39bQ810L4 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Tmem39bQ810L4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmem39bQ810L4 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmem39bQ810L4 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmem39bQ810L4 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmem39bQ810L4 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmem39bQ810L4 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmem39bQ810L4 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmem39bQ810L4 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmem39bQ810L4 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmem39bQ810L4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmem39bQ810L4 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmem39bQ810L4 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmem39bQ810L4 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmem39bQ810L4 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmem39bQ810L4 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmem39bQ810L4 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmem39bQ810L4 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmem39bQ810L4 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmem39bQ810L4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmem39bQ810L4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmem39bQ810L4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmem39bQ810L4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmem39bQ810L4 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmem39bQ810L4 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmem39bQ810L4 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmem39bQ810L4 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmem39bQ810L4 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmem39bQ810L4 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmem39bQ810L4 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmem39bQ810L4 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmem39bQ810L4 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmem39bQ810L4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmem39bQ810L4 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmem39bQ810L4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmem39bQ810L4 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmem39bQ810L4 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmem39bQ810L4 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmem39bQ810L4 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmem39bQ810L4 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmem39bQ810L4 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmem39bQ810L4 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmem39bQ810L4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmem39bQ810L4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmem39bQ810L4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmem39bQ810L4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmem39bQ810L4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmem39bQ810L4 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmem39bQ810L4 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmem39bQ810L4 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmem39bQ810L4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmem39bQ810L4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmem39bQ810L4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmem39bQ810L4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmem39bQ810L4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmem39bQ810L4 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmem39bQ810L4 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmem39bQ810L4 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmem39bQ810L4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmem39bQ810L4 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmem39bQ810L4 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmem39bQ810L4 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmem39bQ810L4 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmem39bQ810L4 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms