Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ChfrQ810L3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ChfrQ810L3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ChfrQ810L3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ChfrQ810L3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ChfrQ810L3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ChfrQ810L3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ChfrQ810L3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ChfrQ810L3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ChfrQ810L3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ChfrQ810L3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ChfrQ810L3 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ChfrQ810L3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ChfrQ810L3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ChfrQ810L3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ChfrQ810L3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ChfrQ810L3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ChfrQ810L3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ChfrQ810L3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ChfrQ810L3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ChfrQ810L3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ChfrQ810L3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ChfrQ810L3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ChfrQ810L3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ChfrQ810L3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ChfrQ810L3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ChfrQ810L3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ChfrQ810L3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ChfrQ810L3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ChfrQ810L3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ChfrQ810L3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ChfrQ810L3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ChfrQ810L3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ChfrQ810L3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ChfrQ810L3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ChfrQ810L3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ChfrQ810L3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ChfrQ810L3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ChfrQ810L3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ChfrQ810L3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ChfrQ810L3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ChfrQ810L3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ChfrQ810L3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ChfrQ810L3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ChfrQ810L3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ChfrQ810L3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ChfrQ810L3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ChfrQ810L3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ChfrQ810L3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ChfrQ810L3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ChfrQ810L3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ChfrQ810L3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ChfrQ810L3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ChfrQ810L3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ChfrQ810L3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ChfrQ810L3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ChfrQ810L3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ChfrQ810L3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ChfrQ810L3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ChfrQ810L3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ChfrQ810L3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ChfrQ810L3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ChfrQ810L3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ChfrQ810L3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ChfrQ810L3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ChfrQ810L3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ChfrQ810L3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ChfrQ810L3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ChfrQ810L3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ChfrQ810L3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ChfrQ810L3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ChfrQ810L3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ChfrQ810L3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ChfrQ810L3 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ChfrQ810L3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ChfrQ810L3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ChfrQ810L3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ChfrQ810L3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ChfrQ810L3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ChfrQ810L3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ChfrQ810L3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ChfrQ810L3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ChfrQ810L3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ChfrQ810L3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ChfrQ810L3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
ChfrQ810L3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ChfrQ810L3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ChfrQ810L3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ChfrQ810L3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ChfrQ810L3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ChfrQ810L3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ChfrQ810L3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ChfrQ810L3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ChfrQ810L3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ChfrQ810L3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ChfrQ810L3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ChfrQ810L3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ChfrQ810L3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ChfrQ810L3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ChfrQ810L3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.2 ms