Protein–RNA interactions for Protein: Q80VJ8

Ccdc155, Protein KASH5, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc155Q80VJ8 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc155Q80VJ8 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc155Q80VJ8 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc155Q80VJ8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc155Q80VJ8 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc155Q80VJ8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc155Q80VJ8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc155Q80VJ8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc155Q80VJ8 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc155Q80VJ8 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc155Q80VJ8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc155Q80VJ8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc155Q80VJ8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc155Q80VJ8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc155Q80VJ8 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc155Q80VJ8 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc155Q80VJ8 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc155Q80VJ8 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc155Q80VJ8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc155Q80VJ8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc155Q80VJ8 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc155Q80VJ8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc155Q80VJ8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc155Q80VJ8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc155Q80VJ8 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc155Q80VJ8 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc155Q80VJ8 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc155Q80VJ8 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc155Q80VJ8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc155Q80VJ8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc155Q80VJ8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc155Q80VJ8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc155Q80VJ8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc155Q80VJ8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc155Q80VJ8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc155Q80VJ8 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc155Q80VJ8 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc155Q80VJ8 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc155Q80VJ8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc155Q80VJ8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc155Q80VJ8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc155Q80VJ8 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc155Q80VJ8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc155Q80VJ8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc155Q80VJ8 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc155Q80VJ8 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc155Q80VJ8 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc155Q80VJ8 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc155Q80VJ8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc155Q80VJ8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc155Q80VJ8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc155Q80VJ8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ccdc155Q80VJ8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc155Q80VJ8 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc155Q80VJ8 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc155Q80VJ8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc155Q80VJ8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc155Q80VJ8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc155Q80VJ8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc155Q80VJ8 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc155Q80VJ8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc155Q80VJ8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc155Q80VJ8 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc155Q80VJ8 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc155Q80VJ8 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc155Q80VJ8 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc155Q80VJ8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc155Q80VJ8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc155Q80VJ8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc155Q80VJ8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc155Q80VJ8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc155Q80VJ8 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc155Q80VJ8 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc155Q80VJ8 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc155Q80VJ8 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc155Q80VJ8 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc155Q80VJ8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc155Q80VJ8 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc155Q80VJ8 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc155Q80VJ8 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc155Q80VJ8 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc155Q80VJ8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc155Q80VJ8 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc155Q80VJ8 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc155Q80VJ8 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc155Q80VJ8 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc155Q80VJ8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc155Q80VJ8 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc155Q80VJ8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc155Q80VJ8 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc155Q80VJ8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc155Q80VJ8 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc155Q80VJ8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc155Q80VJ8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc155Q80VJ8 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc155Q80VJ8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc155Q80VJ8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc155Q80VJ8 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc155Q80VJ8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc155Q80VJ8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms