Protein–RNA interactions for Protein: Q80UK0

Sestd1, SEC14 domain and spectrin repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sestd1Q80UK0 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sestd1Q80UK0 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sestd1Q80UK0 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sestd1Q80UK0 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sestd1Q80UK0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sestd1Q80UK0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sestd1Q80UK0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sestd1Q80UK0 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sestd1Q80UK0 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sestd1Q80UK0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sestd1Q80UK0 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Sestd1Q80UK0 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sestd1Q80UK0 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Sestd1Q80UK0 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sestd1Q80UK0 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sestd1Q80UK0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sestd1Q80UK0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sestd1Q80UK0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sestd1Q80UK0 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sestd1Q80UK0 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Sestd1Q80UK0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sestd1Q80UK0 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sestd1Q80UK0 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sestd1Q80UK0 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Sestd1Q80UK0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sestd1Q80UK0 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sestd1Q80UK0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sestd1Q80UK0 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sestd1Q80UK0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sestd1Q80UK0 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sestd1Q80UK0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sestd1Q80UK0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sestd1Q80UK0 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sestd1Q80UK0 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Sestd1Q80UK0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sestd1Q80UK0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sestd1Q80UK0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sestd1Q80UK0 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sestd1Q80UK0 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sestd1Q80UK0 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sestd1Q80UK0 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sestd1Q80UK0 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sestd1Q80UK0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sestd1Q80UK0 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sestd1Q80UK0 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sestd1Q80UK0 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sestd1Q80UK0 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Sestd1Q80UK0 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sestd1Q80UK0 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sestd1Q80UK0 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sestd1Q80UK0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sestd1Q80UK0 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sestd1Q80UK0 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sestd1Q80UK0 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sestd1Q80UK0 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sestd1Q80UK0 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Sestd1Q80UK0 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sestd1Q80UK0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sestd1Q80UK0 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sestd1Q80UK0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sestd1Q80UK0 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sestd1Q80UK0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sestd1Q80UK0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sestd1Q80UK0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sestd1Q80UK0 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sestd1Q80UK0 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sestd1Q80UK0 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sestd1Q80UK0 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sestd1Q80UK0 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Sestd1Q80UK0 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Sestd1Q80UK0 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sestd1Q80UK0 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sestd1Q80UK0 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sestd1Q80UK0 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sestd1Q80UK0 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sestd1Q80UK0 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sestd1Q80UK0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sestd1Q80UK0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sestd1Q80UK0 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sestd1Q80UK0 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sestd1Q80UK0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sestd1Q80UK0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sestd1Q80UK0 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sestd1Q80UK0 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sestd1Q80UK0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sestd1Q80UK0 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Sestd1Q80UK0 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sestd1Q80UK0 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Sestd1Q80UK0 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sestd1Q80UK0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sestd1Q80UK0 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sestd1Q80UK0 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sestd1Q80UK0 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sestd1Q80UK0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sestd1Q80UK0 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sestd1Q80UK0 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sestd1Q80UK0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sestd1Q80UK0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sestd1Q80UK0 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sestd1Q80UK0 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms