Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Clec18aQ7TSQ1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Clec18aQ7TSQ1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Clec18aQ7TSQ1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Clec18aQ7TSQ1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Clec18aQ7TSQ1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Clec18aQ7TSQ1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Clec18aQ7TSQ1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Clec18aQ7TSQ1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Clec18aQ7TSQ1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Clec18aQ7TSQ1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Clec18aQ7TSQ1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Clec18aQ7TSQ1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Clec18aQ7TSQ1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Clec18aQ7TSQ1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Clec18aQ7TSQ1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Clec18aQ7TSQ1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Clec18aQ7TSQ1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Clec18aQ7TSQ1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Clec18aQ7TSQ1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Clec18aQ7TSQ1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Clec18aQ7TSQ1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Clec18aQ7TSQ1 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Clec18aQ7TSQ1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Clec18aQ7TSQ1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Clec18aQ7TSQ1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Clec18aQ7TSQ1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Clec18aQ7TSQ1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Clec18aQ7TSQ1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Clec18aQ7TSQ1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Clec18aQ7TSQ1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Clec18aQ7TSQ1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Clec18aQ7TSQ1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Clec18aQ7TSQ1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Clec18aQ7TSQ1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Clec18aQ7TSQ1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Clec18aQ7TSQ1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Clec18aQ7TSQ1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Clec18aQ7TSQ1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Clec18aQ7TSQ1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Clec18aQ7TSQ1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Clec18aQ7TSQ1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Clec18aQ7TSQ1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Clec18aQ7TSQ1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Clec18aQ7TSQ1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Clec18aQ7TSQ1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Clec18aQ7TSQ1 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Clec18aQ7TSQ1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Clec18aQ7TSQ1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Clec18aQ7TSQ1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Clec18aQ7TSQ1 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Clec18aQ7TSQ1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Clec18aQ7TSQ1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Clec18aQ7TSQ1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Clec18aQ7TSQ1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Clec18aQ7TSQ1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Clec18aQ7TSQ1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Clec18aQ7TSQ1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Clec18aQ7TSQ1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Clec18aQ7TSQ1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Clec18aQ7TSQ1 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Clec18aQ7TSQ1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Clec18aQ7TSQ1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Clec18aQ7TSQ1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Clec18aQ7TSQ1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Clec18aQ7TSQ1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Clec18aQ7TSQ1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Clec18aQ7TSQ1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Clec18aQ7TSQ1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Clec18aQ7TSQ1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Clec18aQ7TSQ1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Clec18aQ7TSQ1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Clec18aQ7TSQ1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Clec18aQ7TSQ1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Clec18aQ7TSQ1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Clec18aQ7TSQ1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Clec18aQ7TSQ1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Clec18aQ7TSQ1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Clec18aQ7TSQ1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Clec18aQ7TSQ1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Clec18aQ7TSQ1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Clec18aQ7TSQ1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Clec18aQ7TSQ1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Clec18aQ7TSQ1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Clec18aQ7TSQ1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Clec18aQ7TSQ1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Clec18aQ7TSQ1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Clec18aQ7TSQ1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Clec18aQ7TSQ1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Clec18aQ7TSQ1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Clec18aQ7TSQ1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Clec18aQ7TSQ1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Clec18aQ7TSQ1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Clec18aQ7TSQ1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Clec18aQ7TSQ1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Clec18aQ7TSQ1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Clec18aQ7TSQ1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Clec18aQ7TSQ1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Clec18aQ7TSQ1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Clec18aQ7TSQ1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms