Protein–RNA interactions for Protein: Q7TND5

Rpf1, Ribosome production factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpf1Q7TND5 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rpf1Q7TND5 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rpf1Q7TND5 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rpf1Q7TND5 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rpf1Q7TND5 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rpf1Q7TND5 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rpf1Q7TND5 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rpf1Q7TND5 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rpf1Q7TND5 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rpf1Q7TND5 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rpf1Q7TND5 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rpf1Q7TND5 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rpf1Q7TND5 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rpf1Q7TND5 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Rpf1Q7TND5 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rpf1Q7TND5 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rpf1Q7TND5 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rpf1Q7TND5 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rpf1Q7TND5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rpf1Q7TND5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rpf1Q7TND5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rpf1Q7TND5 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rpf1Q7TND5 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rpf1Q7TND5 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rpf1Q7TND5 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rpf1Q7TND5 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rpf1Q7TND5 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rpf1Q7TND5 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rpf1Q7TND5 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rpf1Q7TND5 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rpf1Q7TND5 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rpf1Q7TND5 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rpf1Q7TND5 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rpf1Q7TND5 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rpf1Q7TND5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rpf1Q7TND5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rpf1Q7TND5 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rpf1Q7TND5 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rpf1Q7TND5 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rpf1Q7TND5 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rpf1Q7TND5 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Rpf1Q7TND5 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Rpf1Q7TND5 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rpf1Q7TND5 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rpf1Q7TND5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rpf1Q7TND5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rpf1Q7TND5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rpf1Q7TND5 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rpf1Q7TND5 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rpf1Q7TND5 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rpf1Q7TND5 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rpf1Q7TND5 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rpf1Q7TND5 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rpf1Q7TND5 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rpf1Q7TND5 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Rpf1Q7TND5 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rpf1Q7TND5 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rpf1Q7TND5 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rpf1Q7TND5 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rpf1Q7TND5 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rpf1Q7TND5 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rpf1Q7TND5 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rpf1Q7TND5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rpf1Q7TND5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rpf1Q7TND5 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rpf1Q7TND5 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rpf1Q7TND5 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rpf1Q7TND5 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rpf1Q7TND5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rpf1Q7TND5 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rpf1Q7TND5 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rpf1Q7TND5 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rpf1Q7TND5 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rpf1Q7TND5 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rpf1Q7TND5 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rpf1Q7TND5 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rpf1Q7TND5 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rpf1Q7TND5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rpf1Q7TND5 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rpf1Q7TND5 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Rpf1Q7TND5 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rpf1Q7TND5 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Rpf1Q7TND5 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rpf1Q7TND5 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rpf1Q7TND5 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rpf1Q7TND5 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rpf1Q7TND5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rpf1Q7TND5 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rpf1Q7TND5 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rpf1Q7TND5 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rpf1Q7TND5 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rpf1Q7TND5 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rpf1Q7TND5 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rpf1Q7TND5 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rpf1Q7TND5 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rpf1Q7TND5 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Rpf1Q7TND5 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Rpf1Q7TND5 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Rpf1Q7TND5 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Rpf1Q7TND5 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms