Protein–RNA interactions for Protein: Q6VZZ7

Opn5, Opsin-5, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn5Q6VZZ7 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Opn5Q6VZZ7 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Opn5Q6VZZ7 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Opn5Q6VZZ7 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Opn5Q6VZZ7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Opn5Q6VZZ7 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Opn5Q6VZZ7 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Opn5Q6VZZ7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Opn5Q6VZZ7 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Opn5Q6VZZ7 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Opn5Q6VZZ7 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Opn5Q6VZZ7 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Opn5Q6VZZ7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Opn5Q6VZZ7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Opn5Q6VZZ7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Opn5Q6VZZ7 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Opn5Q6VZZ7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Opn5Q6VZZ7 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Opn5Q6VZZ7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Opn5Q6VZZ7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Opn5Q6VZZ7 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Opn5Q6VZZ7 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Opn5Q6VZZ7 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Opn5Q6VZZ7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Opn5Q6VZZ7 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Opn5Q6VZZ7 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Opn5Q6VZZ7 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Opn5Q6VZZ7 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Opn5Q6VZZ7 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Opn5Q6VZZ7 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Opn5Q6VZZ7 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Opn5Q6VZZ7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Opn5Q6VZZ7 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Opn5Q6VZZ7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Opn5Q6VZZ7 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Opn5Q6VZZ7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Opn5Q6VZZ7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Opn5Q6VZZ7 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Opn5Q6VZZ7 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Opn5Q6VZZ7 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Opn5Q6VZZ7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Opn5Q6VZZ7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Opn5Q6VZZ7 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Opn5Q6VZZ7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Opn5Q6VZZ7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Opn5Q6VZZ7 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Opn5Q6VZZ7 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Opn5Q6VZZ7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Opn5Q6VZZ7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Opn5Q6VZZ7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Opn5Q6VZZ7 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Opn5Q6VZZ7 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Opn5Q6VZZ7 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Opn5Q6VZZ7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Opn5Q6VZZ7 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Opn5Q6VZZ7 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Opn5Q6VZZ7 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Opn5Q6VZZ7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Opn5Q6VZZ7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Opn5Q6VZZ7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Opn5Q6VZZ7 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Opn5Q6VZZ7 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Opn5Q6VZZ7 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Opn5Q6VZZ7 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Opn5Q6VZZ7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Opn5Q6VZZ7 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Opn5Q6VZZ7 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Opn5Q6VZZ7 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Opn5Q6VZZ7 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Opn5Q6VZZ7 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Opn5Q6VZZ7 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Opn5Q6VZZ7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Opn5Q6VZZ7 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Opn5Q6VZZ7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Opn5Q6VZZ7 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Opn5Q6VZZ7 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Opn5Q6VZZ7 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Opn5Q6VZZ7 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Opn5Q6VZZ7 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Opn5Q6VZZ7 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Opn5Q6VZZ7 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Opn5Q6VZZ7 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Opn5Q6VZZ7 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Opn5Q6VZZ7 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Opn5Q6VZZ7 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Opn5Q6VZZ7 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Opn5Q6VZZ7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Opn5Q6VZZ7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Opn5Q6VZZ7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Opn5Q6VZZ7 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Opn5Q6VZZ7 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Opn5Q6VZZ7 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Opn5Q6VZZ7 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Opn5Q6VZZ7 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Opn5Q6VZZ7 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Opn5Q6VZZ7 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Opn5Q6VZZ7 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Opn5Q6VZZ7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Opn5Q6VZZ7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Opn5Q6VZZ7 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms