Protein–RNA interactions for Protein: Q6UJY2

Slc9c1, Sodium/hydrogen exchanger 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9c1Q6UJY2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc9c1Q6UJY2 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc9c1Q6UJY2 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc9c1Q6UJY2 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc9c1Q6UJY2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc9c1Q6UJY2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc9c1Q6UJY2 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc9c1Q6UJY2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc9c1Q6UJY2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc9c1Q6UJY2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc9c1Q6UJY2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc9c1Q6UJY2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc9c1Q6UJY2 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc9c1Q6UJY2 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc9c1Q6UJY2 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc9c1Q6UJY2 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc9c1Q6UJY2 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc9c1Q6UJY2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc9c1Q6UJY2 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc9c1Q6UJY2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc9c1Q6UJY2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc9c1Q6UJY2 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc9c1Q6UJY2 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc9c1Q6UJY2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc9c1Q6UJY2 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc9c1Q6UJY2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc9c1Q6UJY2 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc9c1Q6UJY2 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc9c1Q6UJY2 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc9c1Q6UJY2 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc9c1Q6UJY2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc9c1Q6UJY2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc9c1Q6UJY2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc9c1Q6UJY2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc9c1Q6UJY2 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc9c1Q6UJY2 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc9c1Q6UJY2 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc9c1Q6UJY2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc9c1Q6UJY2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc9c1Q6UJY2 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc9c1Q6UJY2 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc9c1Q6UJY2 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc9c1Q6UJY2 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc9c1Q6UJY2 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc9c1Q6UJY2 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc9c1Q6UJY2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc9c1Q6UJY2 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc9c1Q6UJY2 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc9c1Q6UJY2 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc9c1Q6UJY2 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc9c1Q6UJY2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Slc9c1Q6UJY2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Slc9c1Q6UJY2 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Slc9c1Q6UJY2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc9c1Q6UJY2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc9c1Q6UJY2 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc9c1Q6UJY2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc9c1Q6UJY2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc9c1Q6UJY2 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc9c1Q6UJY2 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc9c1Q6UJY2 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc9c1Q6UJY2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc9c1Q6UJY2 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc9c1Q6UJY2 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc9c1Q6UJY2 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc9c1Q6UJY2 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc9c1Q6UJY2 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc9c1Q6UJY2 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc9c1Q6UJY2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc9c1Q6UJY2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc9c1Q6UJY2 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc9c1Q6UJY2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc9c1Q6UJY2 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc9c1Q6UJY2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc9c1Q6UJY2 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc9c1Q6UJY2 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc9c1Q6UJY2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc9c1Q6UJY2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc9c1Q6UJY2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc9c1Q6UJY2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc9c1Q6UJY2 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc9c1Q6UJY2 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc9c1Q6UJY2 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc9c1Q6UJY2 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc9c1Q6UJY2 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc9c1Q6UJY2 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc9c1Q6UJY2 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc9c1Q6UJY2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc9c1Q6UJY2 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc9c1Q6UJY2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc9c1Q6UJY2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc9c1Q6UJY2 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc9c1Q6UJY2 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc9c1Q6UJY2 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc9c1Q6UJY2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc9c1Q6UJY2 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc9c1Q6UJY2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc9c1Q6UJY2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc9c1Q6UJY2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc9c1Q6UJY2 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms