Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGF5

Bms1, BMS1 homolog, ribosome assembly protein (Yeast), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bms1Q6PGF5 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Bms1Q6PGF5 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Bms1Q6PGF5 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Bms1Q6PGF5 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Bms1Q6PGF5 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Bms1Q6PGF5 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Bms1Q6PGF5 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Bms1Q6PGF5 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Bms1Q6PGF5 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Bms1Q6PGF5 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Bms1Q6PGF5 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Bms1Q6PGF5 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Bms1Q6PGF5 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Bms1Q6PGF5 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Bms1Q6PGF5 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Bms1Q6PGF5 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Bms1Q6PGF5 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Bms1Q6PGF5 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Bms1Q6PGF5 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Bms1Q6PGF5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Bms1Q6PGF5 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Bms1Q6PGF5 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Bms1Q6PGF5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Bms1Q6PGF5 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Bms1Q6PGF5 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Bms1Q6PGF5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Bms1Q6PGF5 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Bms1Q6PGF5 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Bms1Q6PGF5 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Bms1Q6PGF5 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Bms1Q6PGF5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Bms1Q6PGF5 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Bms1Q6PGF5 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Bms1Q6PGF5 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Bms1Q6PGF5 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Bms1Q6PGF5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Bms1Q6PGF5 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Bms1Q6PGF5 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Bms1Q6PGF5 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Bms1Q6PGF5 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Bms1Q6PGF5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Bms1Q6PGF5 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Bms1Q6PGF5 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Bms1Q6PGF5 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Bms1Q6PGF5 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Bms1Q6PGF5 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Bms1Q6PGF5 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Bms1Q6PGF5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Bms1Q6PGF5 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Bms1Q6PGF5 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Bms1Q6PGF5 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Bms1Q6PGF5 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Bms1Q6PGF5 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Bms1Q6PGF5 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Bms1Q6PGF5 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Bms1Q6PGF5 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Bms1Q6PGF5 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Bms1Q6PGF5 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Bms1Q6PGF5 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Bms1Q6PGF5 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Bms1Q6PGF5 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Bms1Q6PGF5 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Bms1Q6PGF5 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Bms1Q6PGF5 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Bms1Q6PGF5 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Bms1Q6PGF5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Bms1Q6PGF5 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Bms1Q6PGF5 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Bms1Q6PGF5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Bms1Q6PGF5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Bms1Q6PGF5 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Bms1Q6PGF5 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Bms1Q6PGF5 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Bms1Q6PGF5 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Bms1Q6PGF5 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Bms1Q6PGF5 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Bms1Q6PGF5 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Bms1Q6PGF5 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Bms1Q6PGF5 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Bms1Q6PGF5 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Bms1Q6PGF5 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Bms1Q6PGF5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Bms1Q6PGF5 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Bms1Q6PGF5 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Bms1Q6PGF5 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Bms1Q6PGF5 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Bms1Q6PGF5 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Bms1Q6PGF5 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Bms1Q6PGF5 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Bms1Q6PGF5 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Bms1Q6PGF5 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Bms1Q6PGF5 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Bms1Q6PGF5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Bms1Q6PGF5 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Bms1Q6PGF5 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Bms1Q6PGF5 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Bms1Q6PGF5 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Bms1Q6PGF5 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Bms1Q6PGF5 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Bms1Q6PGF5 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms