Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAM0

Prkab2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkab2Q6PAM0 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Prkab2Q6PAM0 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Prkab2Q6PAM0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Prkab2Q6PAM0 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Prkab2Q6PAM0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Prkab2Q6PAM0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Prkab2Q6PAM0 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Prkab2Q6PAM0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prkab2Q6PAM0 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prkab2Q6PAM0 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prkab2Q6PAM0 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prkab2Q6PAM0 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prkab2Q6PAM0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prkab2Q6PAM0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prkab2Q6PAM0 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prkab2Q6PAM0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prkab2Q6PAM0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prkab2Q6PAM0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prkab2Q6PAM0 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prkab2Q6PAM0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prkab2Q6PAM0 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prkab2Q6PAM0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prkab2Q6PAM0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prkab2Q6PAM0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prkab2Q6PAM0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prkab2Q6PAM0 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prkab2Q6PAM0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prkab2Q6PAM0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prkab2Q6PAM0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prkab2Q6PAM0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prkab2Q6PAM0 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prkab2Q6PAM0 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Prkab2Q6PAM0 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prkab2Q6PAM0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prkab2Q6PAM0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prkab2Q6PAM0 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prkab2Q6PAM0 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prkab2Q6PAM0 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prkab2Q6PAM0 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Prkab2Q6PAM0 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prkab2Q6PAM0 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prkab2Q6PAM0 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prkab2Q6PAM0 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prkab2Q6PAM0 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prkab2Q6PAM0 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prkab2Q6PAM0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prkab2Q6PAM0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prkab2Q6PAM0 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prkab2Q6PAM0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prkab2Q6PAM0 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prkab2Q6PAM0 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prkab2Q6PAM0 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prkab2Q6PAM0 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prkab2Q6PAM0 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prkab2Q6PAM0 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prkab2Q6PAM0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prkab2Q6PAM0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prkab2Q6PAM0 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prkab2Q6PAM0 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prkab2Q6PAM0 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prkab2Q6PAM0 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prkab2Q6PAM0 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prkab2Q6PAM0 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Prkab2Q6PAM0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prkab2Q6PAM0 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Prkab2Q6PAM0 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prkab2Q6PAM0 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prkab2Q6PAM0 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prkab2Q6PAM0 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prkab2Q6PAM0 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prkab2Q6PAM0 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prkab2Q6PAM0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prkab2Q6PAM0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prkab2Q6PAM0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prkab2Q6PAM0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prkab2Q6PAM0 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prkab2Q6PAM0 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prkab2Q6PAM0 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prkab2Q6PAM0 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prkab2Q6PAM0 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Prkab2Q6PAM0 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prkab2Q6PAM0 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prkab2Q6PAM0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prkab2Q6PAM0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prkab2Q6PAM0 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prkab2Q6PAM0 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prkab2Q6PAM0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prkab2Q6PAM0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prkab2Q6PAM0 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prkab2Q6PAM0 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Prkab2Q6PAM0 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prkab2Q6PAM0 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Prkab2Q6PAM0 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Prkab2Q6PAM0 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prkab2Q6PAM0 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prkab2Q6PAM0 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Prkab2Q6PAM0 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Prkab2Q6PAM0 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Prkab2Q6PAM0 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prkab2Q6PAM0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms