Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9P0

Slf2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slf2Q6P9P0 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slf2Q6P9P0 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slf2Q6P9P0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slf2Q6P9P0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slf2Q6P9P0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slf2Q6P9P0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slf2Q6P9P0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slf2Q6P9P0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slf2Q6P9P0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slf2Q6P9P0 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slf2Q6P9P0 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slf2Q6P9P0 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slf2Q6P9P0 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slf2Q6P9P0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slf2Q6P9P0 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slf2Q6P9P0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slf2Q6P9P0 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slf2Q6P9P0 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Slf2Q6P9P0 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slf2Q6P9P0 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slf2Q6P9P0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Slf2Q6P9P0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Slf2Q6P9P0 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Slf2Q6P9P0 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slf2Q6P9P0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slf2Q6P9P0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slf2Q6P9P0 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slf2Q6P9P0 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slf2Q6P9P0 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slf2Q6P9P0 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slf2Q6P9P0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slf2Q6P9P0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slf2Q6P9P0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slf2Q6P9P0 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slf2Q6P9P0 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Slf2Q6P9P0 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slf2Q6P9P0 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slf2Q6P9P0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slf2Q6P9P0 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slf2Q6P9P0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slf2Q6P9P0 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slf2Q6P9P0 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Slf2Q6P9P0 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slf2Q6P9P0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slf2Q6P9P0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Slf2Q6P9P0 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slf2Q6P9P0 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slf2Q6P9P0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slf2Q6P9P0 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slf2Q6P9P0 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slf2Q6P9P0 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slf2Q6P9P0 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slf2Q6P9P0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slf2Q6P9P0 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slf2Q6P9P0 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slf2Q6P9P0 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slf2Q6P9P0 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slf2Q6P9P0 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slf2Q6P9P0 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slf2Q6P9P0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slf2Q6P9P0 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slf2Q6P9P0 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slf2Q6P9P0 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Slf2Q6P9P0 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slf2Q6P9P0 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Slf2Q6P9P0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Slf2Q6P9P0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slf2Q6P9P0 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slf2Q6P9P0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slf2Q6P9P0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slf2Q6P9P0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slf2Q6P9P0 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slf2Q6P9P0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Slf2Q6P9P0 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slf2Q6P9P0 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slf2Q6P9P0 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slf2Q6P9P0 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slf2Q6P9P0 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slf2Q6P9P0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slf2Q6P9P0 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Slf2Q6P9P0 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slf2Q6P9P0 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slf2Q6P9P0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slf2Q6P9P0 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Slf2Q6P9P0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slf2Q6P9P0 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slf2Q6P9P0 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Slf2Q6P9P0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slf2Q6P9P0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slf2Q6P9P0 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Slf2Q6P9P0 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slf2Q6P9P0 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Slf2Q6P9P0 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Slf2Q6P9P0 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slf2Q6P9P0 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slf2Q6P9P0 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slf2Q6P9P0 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slf2Q6P9P0 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Slf2Q6P9P0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slf2Q6P9P0 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms