Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZQ0

Ccdc189, Coiled-coil domain-containing protein 189, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc189Q6NZQ0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc189Q6NZQ0 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc189Q6NZQ0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc189Q6NZQ0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc189Q6NZQ0 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc189Q6NZQ0 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc189Q6NZQ0 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc189Q6NZQ0 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc189Q6NZQ0 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc189Q6NZQ0 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc189Q6NZQ0 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc189Q6NZQ0 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc189Q6NZQ0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc189Q6NZQ0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc189Q6NZQ0 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc189Q6NZQ0 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc189Q6NZQ0 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc189Q6NZQ0 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc189Q6NZQ0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc189Q6NZQ0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc189Q6NZQ0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc189Q6NZQ0 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc189Q6NZQ0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc189Q6NZQ0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc189Q6NZQ0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc189Q6NZQ0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc189Q6NZQ0 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc189Q6NZQ0 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc189Q6NZQ0 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc189Q6NZQ0 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc189Q6NZQ0 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc189Q6NZQ0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc189Q6NZQ0 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc189Q6NZQ0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc189Q6NZQ0 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc189Q6NZQ0 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc189Q6NZQ0 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc189Q6NZQ0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc189Q6NZQ0 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc189Q6NZQ0 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc189Q6NZQ0 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc189Q6NZQ0 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc189Q6NZQ0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc189Q6NZQ0 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc189Q6NZQ0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ccdc189Q6NZQ0 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ccdc189Q6NZQ0 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc189Q6NZQ0 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc189Q6NZQ0 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc189Q6NZQ0 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc189Q6NZQ0 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc189Q6NZQ0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc189Q6NZQ0 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc189Q6NZQ0 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc189Q6NZQ0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc189Q6NZQ0 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc189Q6NZQ0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc189Q6NZQ0 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc189Q6NZQ0 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc189Q6NZQ0 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc189Q6NZQ0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc189Q6NZQ0 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc189Q6NZQ0 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc189Q6NZQ0 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc189Q6NZQ0 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc189Q6NZQ0 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc189Q6NZQ0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc189Q6NZQ0 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc189Q6NZQ0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc189Q6NZQ0 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc189Q6NZQ0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc189Q6NZQ0 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc189Q6NZQ0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc189Q6NZQ0 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc189Q6NZQ0 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc189Q6NZQ0 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc189Q6NZQ0 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc189Q6NZQ0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc189Q6NZQ0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc189Q6NZQ0 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc189Q6NZQ0 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc189Q6NZQ0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc189Q6NZQ0 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc189Q6NZQ0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc189Q6NZQ0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc189Q6NZQ0 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc189Q6NZQ0 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc189Q6NZQ0 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc189Q6NZQ0 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc189Q6NZQ0 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc189Q6NZQ0 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc189Q6NZQ0 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc189Q6NZQ0 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc189Q6NZQ0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc189Q6NZQ0 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc189Q6NZQ0 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc189Q6NZQ0 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc189Q6NZQ0 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc189Q6NZQ0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc189Q6NZQ0 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms