Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVH0

Tvp23a, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tvp23aQ6NVH0 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tvp23aQ6NVH0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tvp23aQ6NVH0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tvp23aQ6NVH0 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tvp23aQ6NVH0 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tvp23aQ6NVH0 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tvp23aQ6NVH0 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tvp23aQ6NVH0 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tvp23aQ6NVH0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tvp23aQ6NVH0 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tvp23aQ6NVH0 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tvp23aQ6NVH0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tvp23aQ6NVH0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tvp23aQ6NVH0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tvp23aQ6NVH0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tvp23aQ6NVH0 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tvp23aQ6NVH0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tvp23aQ6NVH0 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tvp23aQ6NVH0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tvp23aQ6NVH0 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tvp23aQ6NVH0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tvp23aQ6NVH0 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tvp23aQ6NVH0 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tvp23aQ6NVH0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tvp23aQ6NVH0 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tvp23aQ6NVH0 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tvp23aQ6NVH0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tvp23aQ6NVH0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tvp23aQ6NVH0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tvp23aQ6NVH0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Tvp23aQ6NVH0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tvp23aQ6NVH0 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tvp23aQ6NVH0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tvp23aQ6NVH0 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tvp23aQ6NVH0 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Tvp23aQ6NVH0 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tvp23aQ6NVH0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tvp23aQ6NVH0 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tvp23aQ6NVH0 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tvp23aQ6NVH0 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tvp23aQ6NVH0 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tvp23aQ6NVH0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tvp23aQ6NVH0 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tvp23aQ6NVH0 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tvp23aQ6NVH0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tvp23aQ6NVH0 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tvp23aQ6NVH0 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tvp23aQ6NVH0 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tvp23aQ6NVH0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tvp23aQ6NVH0 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tvp23aQ6NVH0 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tvp23aQ6NVH0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tvp23aQ6NVH0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tvp23aQ6NVH0 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tvp23aQ6NVH0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tvp23aQ6NVH0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tvp23aQ6NVH0 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tvp23aQ6NVH0 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tvp23aQ6NVH0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tvp23aQ6NVH0 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tvp23aQ6NVH0 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tvp23aQ6NVH0 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tvp23aQ6NVH0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tvp23aQ6NVH0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tvp23aQ6NVH0 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tvp23aQ6NVH0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tvp23aQ6NVH0 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tvp23aQ6NVH0 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tvp23aQ6NVH0 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tvp23aQ6NVH0 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tvp23aQ6NVH0 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tvp23aQ6NVH0 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tvp23aQ6NVH0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tvp23aQ6NVH0 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tvp23aQ6NVH0 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tvp23aQ6NVH0 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tvp23aQ6NVH0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tvp23aQ6NVH0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tvp23aQ6NVH0 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Tvp23aQ6NVH0 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tvp23aQ6NVH0 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tvp23aQ6NVH0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tvp23aQ6NVH0 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tvp23aQ6NVH0 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tvp23aQ6NVH0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tvp23aQ6NVH0 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tvp23aQ6NVH0 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tvp23aQ6NVH0 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tvp23aQ6NVH0 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tvp23aQ6NVH0 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tvp23aQ6NVH0 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tvp23aQ6NVH0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tvp23aQ6NVH0 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tvp23aQ6NVH0 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tvp23aQ6NVH0 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tvp23aQ6NVH0 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tvp23aQ6NVH0 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tvp23aQ6NVH0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tvp23aQ6NVH0 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tvp23aQ6NVH0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms