Protein–RNA interactions for Protein: Q6NV83

U2surp, U2 snRNP-associated SURP motif-containing protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2surpQ6NV83 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
U2surpQ6NV83 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
U2surpQ6NV83 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
U2surpQ6NV83 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
U2surpQ6NV83 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
U2surpQ6NV83 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
U2surpQ6NV83 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
U2surpQ6NV83 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
U2surpQ6NV83 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
U2surpQ6NV83 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
U2surpQ6NV83 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
U2surpQ6NV83 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
U2surpQ6NV83 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
U2surpQ6NV83 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
U2surpQ6NV83 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
U2surpQ6NV83 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
U2surpQ6NV83 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
U2surpQ6NV83 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
U2surpQ6NV83 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
U2surpQ6NV83 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
U2surpQ6NV83 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
U2surpQ6NV83 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
U2surpQ6NV83 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
U2surpQ6NV83 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
U2surpQ6NV83 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
U2surpQ6NV83 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
U2surpQ6NV83 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
U2surpQ6NV83 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
U2surpQ6NV83 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
U2surpQ6NV83 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
U2surpQ6NV83 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
U2surpQ6NV83 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
U2surpQ6NV83 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
U2surpQ6NV83 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
U2surpQ6NV83 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
U2surpQ6NV83 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
U2surpQ6NV83 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
U2surpQ6NV83 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
U2surpQ6NV83 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
U2surpQ6NV83 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
U2surpQ6NV83 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
U2surpQ6NV83 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
U2surpQ6NV83 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
U2surpQ6NV83 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
U2surpQ6NV83 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
U2surpQ6NV83 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
U2surpQ6NV83 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
U2surpQ6NV83 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
U2surpQ6NV83 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
U2surpQ6NV83 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
U2surpQ6NV83 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
U2surpQ6NV83 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
U2surpQ6NV83 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
U2surpQ6NV83 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
U2surpQ6NV83 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
U2surpQ6NV83 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
U2surpQ6NV83 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
U2surpQ6NV83 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
U2surpQ6NV83 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
U2surpQ6NV83 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
U2surpQ6NV83 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
U2surpQ6NV83 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
U2surpQ6NV83 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
U2surpQ6NV83 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
U2surpQ6NV83 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
U2surpQ6NV83 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
U2surpQ6NV83 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
U2surpQ6NV83 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
U2surpQ6NV83 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
U2surpQ6NV83 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
U2surpQ6NV83 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
U2surpQ6NV83 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
U2surpQ6NV83 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
U2surpQ6NV83 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
U2surpQ6NV83 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
U2surpQ6NV83 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
U2surpQ6NV83 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
U2surpQ6NV83 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
U2surpQ6NV83 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
U2surpQ6NV83 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
U2surpQ6NV83 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
U2surpQ6NV83 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
U2surpQ6NV83 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
U2surpQ6NV83 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
U2surpQ6NV83 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
U2surpQ6NV83 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
U2surpQ6NV83 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
U2surpQ6NV83 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
U2surpQ6NV83 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
U2surpQ6NV83 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
U2surpQ6NV83 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
U2surpQ6NV83 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
U2surpQ6NV83 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
U2surpQ6NV83 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
U2surpQ6NV83 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
U2surpQ6NV83 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
U2surpQ6NV83 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
U2surpQ6NV83 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
U2surpQ6NV83 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
U2surpQ6NV83 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms