Protein–RNA interactions for Protein: Q6J756

Capn11, Calpain-11, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn11Q6J756 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Capn11Q6J756 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Capn11Q6J756 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Capn11Q6J756 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Capn11Q6J756 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Capn11Q6J756 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Capn11Q6J756 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Capn11Q6J756 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Capn11Q6J756 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Capn11Q6J756 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Capn11Q6J756 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Capn11Q6J756 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Capn11Q6J756 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Capn11Q6J756 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Capn11Q6J756 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Capn11Q6J756 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Capn11Q6J756 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Capn11Q6J756 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Capn11Q6J756 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Capn11Q6J756 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Capn11Q6J756 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Capn11Q6J756 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Capn11Q6J756 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Capn11Q6J756 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Capn11Q6J756 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Capn11Q6J756 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Capn11Q6J756 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Capn11Q6J756 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Capn11Q6J756 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Capn11Q6J756 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Capn11Q6J756 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Capn11Q6J756 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Capn11Q6J756 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Capn11Q6J756 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Capn11Q6J756 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Capn11Q6J756 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Capn11Q6J756 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Capn11Q6J756 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Capn11Q6J756 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Capn11Q6J756 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Capn11Q6J756 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Capn11Q6J756 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Capn11Q6J756 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Capn11Q6J756 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Capn11Q6J756 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Capn11Q6J756 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Capn11Q6J756 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Capn11Q6J756 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Capn11Q6J756 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Capn11Q6J756 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Capn11Q6J756 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Capn11Q6J756 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Capn11Q6J756 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Capn11Q6J756 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Capn11Q6J756 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Capn11Q6J756 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Capn11Q6J756 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Capn11Q6J756 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Capn11Q6J756 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Capn11Q6J756 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Capn11Q6J756 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Capn11Q6J756 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Capn11Q6J756 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Capn11Q6J756 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Capn11Q6J756 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Capn11Q6J756 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Capn11Q6J756 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Capn11Q6J756 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Capn11Q6J756 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Capn11Q6J756 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Capn11Q6J756 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Capn11Q6J756 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Capn11Q6J756 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Capn11Q6J756 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Capn11Q6J756 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Capn11Q6J756 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Capn11Q6J756 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Capn11Q6J756 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Capn11Q6J756 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Capn11Q6J756 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Capn11Q6J756 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Capn11Q6J756 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Capn11Q6J756 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Capn11Q6J756 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Capn11Q6J756 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Capn11Q6J756 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Capn11Q6J756 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Capn11Q6J756 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Capn11Q6J756 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Capn11Q6J756 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Capn11Q6J756 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Capn11Q6J756 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Capn11Q6J756 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Capn11Q6J756 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Capn11Q6J756 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Capn11Q6J756 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Capn11Q6J756 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Capn11Q6J756 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Capn11Q6J756 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Capn11Q6J756 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms