Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Nop58Q6DFW4 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Nop58Q6DFW4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Nop58Q6DFW4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Nop58Q6DFW4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Nop58Q6DFW4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Nop58Q6DFW4 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Nop58Q6DFW4 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nop58Q6DFW4 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nop58Q6DFW4 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nop58Q6DFW4 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nop58Q6DFW4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nop58Q6DFW4 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Nop58Q6DFW4 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nop58Q6DFW4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nop58Q6DFW4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nop58Q6DFW4 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nop58Q6DFW4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Nop58Q6DFW4 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nop58Q6DFW4 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nop58Q6DFW4 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nop58Q6DFW4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nop58Q6DFW4 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nop58Q6DFW4 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nop58Q6DFW4 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nop58Q6DFW4 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nop58Q6DFW4 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Nop58Q6DFW4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Nop58Q6DFW4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Nop58Q6DFW4 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Nop58Q6DFW4 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Nop58Q6DFW4 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Nop58Q6DFW4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Nop58Q6DFW4 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Nop58Q6DFW4 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Nop58Q6DFW4 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Nop58Q6DFW4 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Nop58Q6DFW4 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Nop58Q6DFW4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Nop58Q6DFW4 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Nop58Q6DFW4 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Nop58Q6DFW4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Nop58Q6DFW4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nop58Q6DFW4 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nop58Q6DFW4 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nop58Q6DFW4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nop58Q6DFW4 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nop58Q6DFW4 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Nop58Q6DFW4 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nop58Q6DFW4 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nop58Q6DFW4 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nop58Q6DFW4 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Nop58Q6DFW4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nop58Q6DFW4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Nop58Q6DFW4 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Nop58Q6DFW4 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Nop58Q6DFW4 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Nop58Q6DFW4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Nop58Q6DFW4 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Nop58Q6DFW4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Nop58Q6DFW4 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Nop58Q6DFW4 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Nop58Q6DFW4 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Nop58Q6DFW4 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nop58Q6DFW4 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nop58Q6DFW4 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nop58Q6DFW4 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nop58Q6DFW4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nop58Q6DFW4 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nop58Q6DFW4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nop58Q6DFW4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nop58Q6DFW4 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nop58Q6DFW4 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nop58Q6DFW4 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Nop58Q6DFW4 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nop58Q6DFW4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nop58Q6DFW4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nop58Q6DFW4 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nop58Q6DFW4 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nop58Q6DFW4 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nop58Q6DFW4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nop58Q6DFW4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nop58Q6DFW4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Nop58Q6DFW4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nop58Q6DFW4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nop58Q6DFW4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nop58Q6DFW4 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Nop58Q6DFW4 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Nop58Q6DFW4 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Nop58Q6DFW4 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Nop58Q6DFW4 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Nop58Q6DFW4 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Nop58Q6DFW4 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Nop58Q6DFW4 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Nop58Q6DFW4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Nop58Q6DFW4 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Nop58Q6DFW4 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Nop58Q6DFW4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Nop58Q6DFW4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Nop58Q6DFW4 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms