Protein–RNA interactions for Protein: Q6A068

Cdc5l, Cell division cycle 5-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc5lQ6A068 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdc5lQ6A068 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdc5lQ6A068 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdc5lQ6A068 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdc5lQ6A068 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdc5lQ6A068 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdc5lQ6A068 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdc5lQ6A068 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdc5lQ6A068 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdc5lQ6A068 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdc5lQ6A068 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdc5lQ6A068 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdc5lQ6A068 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdc5lQ6A068 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdc5lQ6A068 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdc5lQ6A068 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdc5lQ6A068 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdc5lQ6A068 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdc5lQ6A068 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdc5lQ6A068 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdc5lQ6A068 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdc5lQ6A068 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdc5lQ6A068 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdc5lQ6A068 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdc5lQ6A068 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdc5lQ6A068 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdc5lQ6A068 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdc5lQ6A068 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdc5lQ6A068 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdc5lQ6A068 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdc5lQ6A068 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdc5lQ6A068 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdc5lQ6A068 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdc5lQ6A068 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdc5lQ6A068 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdc5lQ6A068 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdc5lQ6A068 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdc5lQ6A068 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdc5lQ6A068 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdc5lQ6A068 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdc5lQ6A068 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdc5lQ6A068 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdc5lQ6A068 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdc5lQ6A068 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdc5lQ6A068 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdc5lQ6A068 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdc5lQ6A068 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdc5lQ6A068 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdc5lQ6A068 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdc5lQ6A068 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdc5lQ6A068 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdc5lQ6A068 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdc5lQ6A068 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdc5lQ6A068 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdc5lQ6A068 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdc5lQ6A068 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdc5lQ6A068 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdc5lQ6A068 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdc5lQ6A068 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdc5lQ6A068 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdc5lQ6A068 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdc5lQ6A068 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdc5lQ6A068 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdc5lQ6A068 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdc5lQ6A068 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdc5lQ6A068 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdc5lQ6A068 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdc5lQ6A068 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdc5lQ6A068 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdc5lQ6A068 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdc5lQ6A068 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdc5lQ6A068 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdc5lQ6A068 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdc5lQ6A068 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdc5lQ6A068 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdc5lQ6A068 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdc5lQ6A068 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdc5lQ6A068 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdc5lQ6A068 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdc5lQ6A068 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdc5lQ6A068 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdc5lQ6A068 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdc5lQ6A068 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdc5lQ6A068 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdc5lQ6A068 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdc5lQ6A068 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdc5lQ6A068 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdc5lQ6A068 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdc5lQ6A068 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdc5lQ6A068 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdc5lQ6A068 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdc5lQ6A068 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdc5lQ6A068 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdc5lQ6A068 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdc5lQ6A068 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdc5lQ6A068 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdc5lQ6A068 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdc5lQ6A068 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdc5lQ6A068 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdc5lQ6A068 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms