Protein–RNA interactions for Protein: Q6A028

Swap70, Switch-associated protein 70, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 585 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swap70Q6A028 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Swap70Q6A028 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Swap70Q6A028 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Swap70Q6A028 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Swap70Q6A028 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Swap70Q6A028 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Swap70Q6A028 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Swap70Q6A028 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Swap70Q6A028 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Swap70Q6A028 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Swap70Q6A028 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Swap70Q6A028 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Swap70Q6A028 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Swap70Q6A028 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Swap70Q6A028 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Swap70Q6A028 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Swap70Q6A028 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Swap70Q6A028 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Swap70Q6A028 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Swap70Q6A028 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Swap70Q6A028 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Swap70Q6A028 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Swap70Q6A028 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Swap70Q6A028 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Swap70Q6A028 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Swap70Q6A028 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Swap70Q6A028 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Swap70Q6A028 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Swap70Q6A028 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Swap70Q6A028 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Swap70Q6A028 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Swap70Q6A028 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Swap70Q6A028 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Swap70Q6A028 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Swap70Q6A028 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Swap70Q6A028 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Swap70Q6A028 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Swap70Q6A028 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Swap70Q6A028 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Swap70Q6A028 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Swap70Q6A028 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Swap70Q6A028 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Swap70Q6A028 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Swap70Q6A028 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Swap70Q6A028 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Swap70Q6A028 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Swap70Q6A028 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Swap70Q6A028 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Swap70Q6A028 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Swap70Q6A028 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Swap70Q6A028 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Swap70Q6A028 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Swap70Q6A028 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Swap70Q6A028 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Swap70Q6A028 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Swap70Q6A028 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Swap70Q6A028 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Swap70Q6A028 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Swap70Q6A028 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Swap70Q6A028 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Swap70Q6A028 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Swap70Q6A028 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Swap70Q6A028 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Swap70Q6A028 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Swap70Q6A028 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Swap70Q6A028 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Swap70Q6A028 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Swap70Q6A028 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Swap70Q6A028 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Swap70Q6A028 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Swap70Q6A028 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Swap70Q6A028 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Swap70Q6A028 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Swap70Q6A028 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Swap70Q6A028 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Swap70Q6A028 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Swap70Q6A028 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Swap70Q6A028 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Swap70Q6A028 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Swap70Q6A028 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Swap70Q6A028 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Swap70Q6A028 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Swap70Q6A028 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Swap70Q6A028 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Swap70Q6A028 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Swap70Q6A028 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Swap70Q6A028 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Swap70Q6A028 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Swap70Q6A028 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Swap70Q6A028 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Swap70Q6A028 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Swap70Q6A028 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Swap70Q6A028 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Swap70Q6A028 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Swap70Q6A028 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Swap70Q6A028 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Swap70Q6A028 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Swap70Q6A028 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Swap70Q6A028 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Swap70Q6A028 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms